Protein–RNA interactions for Protein: P83105

HTRA4, Serine protease HTRA4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA4P83105 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HTRA4P83105 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
HTRA4P83105 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HTRA4P83105 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
HTRA4P83105 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HTRA4P83105 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HTRA4P83105 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HTRA4P83105 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HTRA4P83105 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HTRA4P83105 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HTRA4P83105 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HTRA4P83105 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HTRA4P83105 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HTRA4P83105 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HTRA4P83105 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HTRA4P83105 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HTRA4P83105 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HTRA4P83105 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HTRA4P83105 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
HTRA4P83105 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HTRA4P83105 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HTRA4P83105 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HTRA4P83105 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HTRA4P83105 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HTRA4P83105 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
HTRA4P83105 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
HTRA4P83105 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HTRA4P83105 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HTRA4P83105 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HTRA4P83105 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HTRA4P83105 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HTRA4P83105 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HTRA4P83105 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HTRA4P83105 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HTRA4P83105 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HTRA4P83105 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HTRA4P83105 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HTRA4P83105 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HTRA4P83105 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HTRA4P83105 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HTRA4P83105 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HTRA4P83105 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HTRA4P83105 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HTRA4P83105 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HTRA4P83105 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HTRA4P83105 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HTRA4P83105 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HTRA4P83105 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HTRA4P83105 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
HTRA4P83105 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HTRA4P83105 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HTRA4P83105 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HTRA4P83105 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HTRA4P83105 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HTRA4P83105 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HTRA4P83105 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HTRA4P83105 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HTRA4P83105 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HTRA4P83105 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
HTRA4P83105 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HTRA4P83105 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HTRA4P83105 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HTRA4P83105 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HTRA4P83105 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
HTRA4P83105 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HTRA4P83105 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HTRA4P83105 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HTRA4P83105 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HTRA4P83105 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HTRA4P83105 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HTRA4P83105 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HTRA4P83105 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HTRA4P83105 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HTRA4P83105 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
HTRA4P83105 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
HTRA4P83105 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HTRA4P83105 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HTRA4P83105 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HTRA4P83105 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HTRA4P83105 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HTRA4P83105 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HTRA4P83105 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HTRA4P83105 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HTRA4P83105 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HTRA4P83105 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HTRA4P83105 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HTRA4P83105 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HTRA4P83105 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HTRA4P83105 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HTRA4P83105 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HTRA4P83105 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HTRA4P83105 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HTRA4P83105 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HTRA4P83105 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HTRA4P83105 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HTRA4P83105 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
HTRA4P83105 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HTRA4P83105 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
HTRA4P83105 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HTRA4P83105 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms