Protein–RNA interactions for Protein: P80217

IFI35, Interferon-induced 35 kDa protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFI35P80217 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
IFI35P80217 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
IFI35P80217 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
IFI35P80217 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IFI35P80217 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IFI35P80217 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
IFI35P80217 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IFI35P80217 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IFI35P80217 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IFI35P80217 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
IFI35P80217 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IFI35P80217 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IFI35P80217 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IFI35P80217 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IFI35P80217 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IFI35P80217 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IFI35P80217 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IFI35P80217 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
IFI35P80217 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IFI35P80217 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
IFI35P80217 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
IFI35P80217 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IFI35P80217 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IFI35P80217 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
IFI35P80217 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IFI35P80217 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IFI35P80217 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IFI35P80217 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
IFI35P80217 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
IFI35P80217 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IFI35P80217 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IFI35P80217 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IFI35P80217 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IFI35P80217 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IFI35P80217 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IFI35P80217 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IFI35P80217 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IFI35P80217 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IFI35P80217 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IFI35P80217 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IFI35P80217 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IFI35P80217 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IFI35P80217 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
IFI35P80217 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
IFI35P80217 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IFI35P80217 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
IFI35P80217 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
IFI35P80217 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IFI35P80217 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IFI35P80217 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IFI35P80217 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IFI35P80217 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IFI35P80217 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IFI35P80217 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IFI35P80217 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IFI35P80217 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IFI35P80217 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
IFI35P80217 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IFI35P80217 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFI35P80217 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFI35P80217 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFI35P80217 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFI35P80217 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFI35P80217 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IFI35P80217 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
IFI35P80217 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IFI35P80217 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFI35P80217 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFI35P80217 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
IFI35P80217 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFI35P80217 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
IFI35P80217 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IFI35P80217 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IFI35P80217 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IFI35P80217 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IFI35P80217 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IFI35P80217 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IFI35P80217 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFI35P80217 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
IFI35P80217 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFI35P80217 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFI35P80217 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IFI35P80217 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IFI35P80217 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IFI35P80217 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IFI35P80217 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IFI35P80217 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IFI35P80217 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
IFI35P80217 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IFI35P80217 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
IFI35P80217 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IFI35P80217 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IFI35P80217 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IFI35P80217 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IFI35P80217 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IFI35P80217 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IFI35P80217 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IFI35P80217 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IFI35P80217 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IFI35P80217 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms