Protein–RNA interactions for Protein: P78344

EIF4G2, Eukaryotic translation initiation factor 4 gamma 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4G2P78344 IQCE-211ENST00000470731 2251 ntTSL 1 (best)28.4■■■□□ 2.149e-7■■■■■ 43.5
EIF4G2P78344 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.359e-7■■■■■ 43.5
EIF4G2P78344 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.349e-7■■■■■ 43.5
EIF4G2P78344 IQCE-208ENST00000423395 543 ntTSL 522.9■■□□□ 1.269e-7■■■■■ 43.5
EIF4G2P78344 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.259e-7■■■■■ 43.5
EIF4G2P78344 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.129e-7■■■■■ 43.5
EIF4G2P78344 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.939e-7■■■■■ 43.5
EIF4G2P78344 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.879e-7■■■■■ 43.5
EIF4G2P78344 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.819e-7■■■■■ 43.5
EIF4G2P78344 PDXK-206ENST00000398085 796 ntTSL 330.19■■■□□ 2.423e-7■■■■■ 43.4
EIF4G2P78344 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.433e-7■■■■■ 43.4
EIF4G2P78344 PDXK-201ENST00000291565 7366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.143e-7■■■■■ 43.4
EIF4G2P78344 CDC42EP4-205ENST00000580315 1022 ntTSL 234.63■■■■□ 3.131e-15■■■■■ 43.4
EIF4G2P78344 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.345e-7■■■■■ 43.4
EIF4G2P78344 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.135e-7■■■■■ 43.4
EIF4G2P78344 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.465e-7■■■■■ 43.4
EIF4G2P78344 NCKAP1L-201ENST00000293373 9016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.711e-7■■■■■ 43.4
EIF4G2P78344 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.637e-9■■■■■ 43.2
EIF4G2P78344 TRIM25-202ENST00000537230 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.487e-9■■■■■ 43.2
EIF4G2P78344 TRIM25-205ENST00000572021 1555 ntTSL 1 (best)16.69■□□□□ 0.267e-9■■■■■ 43.2
EIF4G2P78344 TRIM25-208ENST00000574234 471 ntTSL 27□□□□□ -1.297e-9■■■■■ 43.2
EIF4G2P78344 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.211e-6■■■■■ 43.2
EIF4G2P78344 LRP5-206ENST00000529993 5103 ntTSL 1 (best)20.34■□□□□ 0.851e-6■■■■■ 43.2
EIF4G2P78344 APBA2-202ENST00000411764 3599 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.163e-7■■■■■ 43.1
EIF4G2P78344 APBA2-204ENST00000558259 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.143e-7■■■■■ 43.1
EIF4G2P78344 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.892e-18■■■■■ 43.1
EIF4G2P78344 INPP5A-201ENST00000342652 832 ntTSL 514.1□□□□□ -0.159e-7■■■■■ 43.1
EIF4G2P78344 PDXK-204ENST00000398078 1069 ntTSL 223.37■■□□□ 1.339e-8■■■■■ 43.1
EIF4G2P78344 PDXK-211ENST00000468392 1094 ntTSL 220.92■□□□□ 0.949e-8■■■■■ 43.1
EIF4G2P78344 PDXK-217ENST00000490666 577 ntTSL 520.08■□□□□ 0.819e-8■■■■■ 43.1
EIF4G2P78344 PDXK-203ENST00000343528 1101 ntTSL 1 (best)19.61■□□□□ 0.739e-8■■■■■ 43.1
EIF4G2P78344 PDXK-209ENST00000467908 7194 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.059e-8■■■■■ 43.1
EIF4G2P78344 PDXK-216ENST00000481512 583 ntTSL 513.7□□□□□ -0.229e-8■■■■■ 43.1
EIF4G2P78344 LINC01169-201ENST00000558797 833 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.223e-7■■■■■ 43.1
EIF4G2P78344 NPHP4-206ENST00000468253 781 ntTSL 228.07■■■□□ 2.082e-7■■■■■ 43
EIF4G2P78344 BPHL-206ENST00000430655 2157 ntTSL 1 (best)33.7■■■□□ 2.993e-10■■■■■ 43
EIF4G2P78344 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.873e-10■■■■■ 43
EIF4G2P78344 BPHL-205ENST00000424847 1563 ntTSL 1 (best)32.64■■■□□ 2.823e-10■■■■■ 43
EIF4G2P78344 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.583e-10■■■■■ 43
EIF4G2P78344 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.163e-10■■■■■ 43
EIF4G2P78344 BPHL-207ENST00000433912 1063 ntTSL 228.24■■■□□ 2.113e-10■■■■■ 43
EIF4G2P78344 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.043e-10■■■■■ 43
EIF4G2P78344 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.853e-10■■■■■ 43
EIF4G2P78344 FBXO41-202ENST00000519873 580 ntTSL 425.88■■□□□ 1.733e-10■■■■■ 43
EIF4G2P78344 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.713e-10■■■■■ 43
EIF4G2P78344 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.673e-10■■■■■ 43
EIF4G2P78344 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.653e-10■■■■■ 43
EIF4G2P78344 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.553e-10■■■■■ 43
EIF4G2P78344 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.523e-10■■■■■ 43
EIF4G2P78344 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.443e-10■■■■■ 43
EIF4G2P78344 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.443e-10■■■■■ 43
EIF4G2P78344 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.363e-10■■■■■ 43
EIF4G2P78344 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.363e-10■■■■■ 43
EIF4G2P78344 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.033e-10■■■■■ 43
EIF4G2P78344 FN3KRP-208ENST00000576363 666 ntTSL 1 (best)20.85■□□□□ 0.933e-10■■■■■ 43
EIF4G2P78344 RPS6KB1-205ENST00000472940 2808 ntTSL 219.8■□□□□ 0.763e-10■■■■■ 43
EIF4G2P78344 FN3KRP-202ENST00000571482 311 ntTSL 519.68■□□□□ 0.743e-10■■■■■ 43
EIF4G2P78344 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.743e-10■■■■■ 43
EIF4G2P78344 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.683e-10■■■■■ 43
EIF4G2P78344 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.673e-10■■■■■ 43
EIF4G2P78344 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.653e-10■■■■■ 43
EIF4G2P78344 COPS7B-210ENST00000413197 2442 ntTSL 218.99■□□□□ 0.633e-10■■■■■ 43
EIF4G2P78344 COPS7B-201ENST00000350033 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.63e-10■■■■■ 43
EIF4G2P78344 BPHL-212ENST00000490918 3723 ntTSL 216.66■□□□□ 0.263e-10■■■■■ 43
EIF4G2P78344 RPS6KB1-202ENST00000393021 5479 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.243e-10■■■■■ 43
EIF4G2P78344 EED-211ENST00000534595 713 ntTSL 316.41■□□□□ 0.223e-10■■■■■ 43
EIF4G2P78344 BPHL-211ENST00000488487 1137 ntTSL 515.71■□□□□ 0.113e-10■■■■■ 43
EIF4G2P78344 RPS6KB1-201ENST00000225577 5375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.273e-10■■■■■ 43
EIF4G2P78344 BPHL-202ENST00000380375 1050 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.373e-10■■■■■ 43
EIF4G2P78344 BPHL-204ENST00000423798 576 ntTSL 312.68□□□□□ -0.383e-10■■■■■ 43
EIF4G2P78344 EED-204ENST00000524673 1155 ntTSL 311.22□□□□□ -0.613e-10■■■■■ 43
EIF4G2P78344 PRKAR2B-202ENST00000393613 642 ntTSL 39.5□□□□□ -0.893e-10■■■■■ 43
EIF4G2P78344 PTH2R-202ENST00000419079 811 ntTSL 28.55□□□□□ -1.043e-10■■■■■ 43
EIF4G2P78344 EED-203ENST00000351625 1696 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.193e-10■■■■■ 43
EIF4G2P78344 PRKAR2B-203ENST00000488792 609 ntTSL 37.04□□□□□ -1.283e-10■■■■■ 43
EIF4G2P78344 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.413e-10■■■■■ 43
EIF4G2P78344 EED-205ENST00000525244 1484 ntTSL 25.88□□□□□ -1.473e-10■■■■■ 43
EIF4G2P78344 UBE4A-201ENST00000252108 6103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.53e-10■■■■■ 43
EIF4G2P78344 UBE4A-203ENST00000545354 2149 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.523e-10■■■■■ 43
EIF4G2P78344 EED-210ENST00000534564 2767 ntTSL 23.71□□□□□ -1.823e-10■■■■■ 43
EIF4G2P78344 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.544e-10■■■■■ 42.9
EIF4G2P78344 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.334e-10■■■■■ 42.9
EIF4G2P78344 C22orf39-204ENST00000509549 2979 ntTSL 217.12■□□□□ 0.334e-10■■■■■ 42.9
EIF4G2P78344 HIRA-204ENST00000464189 560 ntTSL 415.31■□□□□ 0.044e-10■■■■■ 42.9
EIF4G2P78344 HIRA-203ENST00000452818 453 ntTSL 515.31■□□□□ 0.044e-10■■■■■ 42.9
EIF4G2P78344 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.871e-7■■■■■ 42.8
EIF4G2P78344 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.851e-7■■■■■ 42.8
EIF4G2P78344 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.81e-7■■■■■ 42.8
EIF4G2P78344 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.551e-7■■■■■ 42.8
EIF4G2P78344 TRRAP-203ENST00000417523 550 ntTSL 422.51■■□□□ 1.192e-71■■■■■ 42.8
EIF4G2P78344 TRRAP-201ENST00000355540 12590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.872e-71■■■■■ 42.8
EIF4G2P78344 TRRAP-202ENST00000359863 12677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.92e-71■■■■■ 42.8
EIF4G2P78344 TRRAP-207ENST00000628380 12644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.922e-71■■■■■ 42.8
EIF4G2P78344 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.132e-71■■■■■ 42.8
EIF4G2P78344 TVP23C-CDRT4-204ENST00000557349 1005 ntTSL 223.4■■□□□ 1.346e-8■■■■■ 42.7
EIF4G2P78344 TVP23C-CDRT4-203ENST00000522212 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.356e-8■■■■■ 42.7
EIF4G2P78344 CDRT4-204ENST00000619038 2498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.036e-8■■■■■ 42.7
EIF4G2P78344 CDRT4-203ENST00000524205 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 214.59□□□□□ -0.076e-8■■■■■ 42.7
EIF4G2P78344 TVP23C-CDRT4-201ENST00000481756 556 ntTSL 48.08□□□□□ -1.126e-8■■■■■ 42.7
EIF4G2P78344 CDRT4-202ENST00000520956 470 ntTSL 44.96□□□□□ -1.626e-8■■■■■ 42.7
Retrieved 100 of 8,962 protein–RNA pairs in 50.1 ms