Protein–RNA interactions for Protein: P78333

GPC5, Glypican-5, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC5P78333 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GPC5P78333 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GPC5P78333 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GPC5P78333 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GPC5P78333 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GPC5P78333 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GPC5P78333 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GPC5P78333 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GPC5P78333 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GPC5P78333 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GPC5P78333 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GPC5P78333 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
GPC5P78333 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
GPC5P78333 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GPC5P78333 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GPC5P78333 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GPC5P78333 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
GPC5P78333 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GPC5P78333 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GPC5P78333 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GPC5P78333 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GPC5P78333 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GPC5P78333 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GPC5P78333 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
GPC5P78333 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
GPC5P78333 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GPC5P78333 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GPC5P78333 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GPC5P78333 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GPC5P78333 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GPC5P78333 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GPC5P78333 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GPC5P78333 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GPC5P78333 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GPC5P78333 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
GPC5P78333 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GPC5P78333 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GPC5P78333 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GPC5P78333 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GPC5P78333 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GPC5P78333 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GPC5P78333 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GPC5P78333 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GPC5P78333 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GPC5P78333 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GPC5P78333 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GPC5P78333 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GPC5P78333 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GPC5P78333 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GPC5P78333 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GPC5P78333 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GPC5P78333 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GPC5P78333 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GPC5P78333 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GPC5P78333 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GPC5P78333 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GPC5P78333 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GPC5P78333 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GPC5P78333 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GPC5P78333 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GPC5P78333 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GPC5P78333 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GPC5P78333 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GPC5P78333 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GPC5P78333 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GPC5P78333 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GPC5P78333 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GPC5P78333 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GPC5P78333 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GPC5P78333 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GPC5P78333 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GPC5P78333 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GPC5P78333 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GPC5P78333 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GPC5P78333 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GPC5P78333 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GPC5P78333 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GPC5P78333 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GPC5P78333 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GPC5P78333 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GPC5P78333 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GPC5P78333 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GPC5P78333 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
GPC5P78333 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GPC5P78333 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GPC5P78333 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GPC5P78333 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GPC5P78333 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GPC5P78333 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GPC5P78333 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GPC5P78333 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GPC5P78333 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GPC5P78333 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GPC5P78333 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GPC5P78333 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GPC5P78333 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GPC5P78333 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GPC5P78333 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GPC5P78333 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
GPC5P78333 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms