Protein–RNA interactions for Protein: P78312

FAM193A, Protein FAM193A, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM193AP78312 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FAM193AP78312 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
FAM193AP78312 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FAM193AP78312 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FAM193AP78312 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
FAM193AP78312 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
FAM193AP78312 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
FAM193AP78312 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
FAM193AP78312 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
FAM193AP78312 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
FAM193AP78312 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FAM193AP78312 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FAM193AP78312 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FAM193AP78312 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FAM193AP78312 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FAM193AP78312 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
FAM193AP78312 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FAM193AP78312 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
FAM193AP78312 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FAM193AP78312 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FAM193AP78312 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FAM193AP78312 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
FAM193AP78312 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FAM193AP78312 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FAM193AP78312 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FAM193AP78312 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FAM193AP78312 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FAM193AP78312 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FAM193AP78312 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FAM193AP78312 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FAM193AP78312 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FAM193AP78312 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FAM193AP78312 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FAM193AP78312 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FAM193AP78312 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
FAM193AP78312 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FAM193AP78312 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FAM193AP78312 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FAM193AP78312 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FAM193AP78312 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FAM193AP78312 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
FAM193AP78312 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
FAM193AP78312 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FAM193AP78312 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
FAM193AP78312 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FAM193AP78312 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FAM193AP78312 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
FAM193AP78312 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FAM193AP78312 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FAM193AP78312 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FAM193AP78312 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FAM193AP78312 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FAM193AP78312 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FAM193AP78312 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FAM193AP78312 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FAM193AP78312 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FAM193AP78312 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FAM193AP78312 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FAM193AP78312 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FAM193AP78312 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FAM193AP78312 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FAM193AP78312 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
FAM193AP78312 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FAM193AP78312 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FAM193AP78312 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FAM193AP78312 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FAM193AP78312 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FAM193AP78312 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FAM193AP78312 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FAM193AP78312 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FAM193AP78312 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FAM193AP78312 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FAM193AP78312 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FAM193AP78312 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FAM193AP78312 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FAM193AP78312 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FAM193AP78312 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FAM193AP78312 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FAM193AP78312 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FAM193AP78312 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FAM193AP78312 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FAM193AP78312 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FAM193AP78312 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FAM193AP78312 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FAM193AP78312 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FAM193AP78312 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FAM193AP78312 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FAM193AP78312 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FAM193AP78312 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FAM193AP78312 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FAM193AP78312 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FAM193AP78312 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FAM193AP78312 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
FAM193AP78312 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FAM193AP78312 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FAM193AP78312 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FAM193AP78312 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FAM193AP78312 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FAM193AP78312 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FAM193AP78312 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms