Protein–RNA interactions for Protein: P68104

EEF1A1, Elongation factor 1-alpha 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1A1P68104 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EEF1A1P68104 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EEF1A1P68104 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EEF1A1P68104 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EEF1A1P68104 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EEF1A1P68104 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
EEF1A1P68104 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EEF1A1P68104 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EEF1A1P68104 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EEF1A1P68104 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EEF1A1P68104 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EEF1A1P68104 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EEF1A1P68104 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EEF1A1P68104 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EEF1A1P68104 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EEF1A1P68104 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EEF1A1P68104 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EEF1A1P68104 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EEF1A1P68104 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EEF1A1P68104 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EEF1A1P68104 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EEF1A1P68104 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EEF1A1P68104 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EEF1A1P68104 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EEF1A1P68104 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EEF1A1P68104 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EEF1A1P68104 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
EEF1A1P68104 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EEF1A1P68104 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EEF1A1P68104 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EEF1A1P68104 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EEF1A1P68104 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EEF1A1P68104 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EEF1A1P68104 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EEF1A1P68104 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
EEF1A1P68104 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
EEF1A1P68104 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
EEF1A1P68104 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EEF1A1P68104 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EEF1A1P68104 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EEF1A1P68104 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EEF1A1P68104 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EEF1A1P68104 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EEF1A1P68104 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EEF1A1P68104 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EEF1A1P68104 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EEF1A1P68104 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EEF1A1P68104 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EEF1A1P68104 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EEF1A1P68104 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EEF1A1P68104 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EEF1A1P68104 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EEF1A1P68104 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EEF1A1P68104 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
EEF1A1P68104 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
EEF1A1P68104 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EEF1A1P68104 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EEF1A1P68104 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EEF1A1P68104 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EEF1A1P68104 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EEF1A1P68104 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EEF1A1P68104 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EEF1A1P68104 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EEF1A1P68104 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EEF1A1P68104 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EEF1A1P68104 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
EEF1A1P68104 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EEF1A1P68104 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
EEF1A1P68104 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EEF1A1P68104 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EEF1A1P68104 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EEF1A1P68104 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EEF1A1P68104 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EEF1A1P68104 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EEF1A1P68104 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EEF1A1P68104 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EEF1A1P68104 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EEF1A1P68104 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EEF1A1P68104 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EEF1A1P68104 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EEF1A1P68104 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EEF1A1P68104 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EEF1A1P68104 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EEF1A1P68104 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EEF1A1P68104 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EEF1A1P68104 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EEF1A1P68104 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EEF1A1P68104 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EEF1A1P68104 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EEF1A1P68104 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EEF1A1P68104 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EEF1A1P68104 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EEF1A1P68104 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EEF1A1P68104 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EEF1A1P68104 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EEF1A1P68104 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EEF1A1P68104 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
EEF1A1P68104 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
EEF1A1P68104 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EEF1A1P68104 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms