Protein–RNA interactions for Protein: P63244

RACK1, Receptor of activated protein C kinase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RACK1P63244 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RACK1P63244 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RACK1P63244 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
RACK1P63244 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RACK1P63244 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RACK1P63244 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RACK1P63244 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RACK1P63244 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RACK1P63244 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RACK1P63244 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RACK1P63244 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RACK1P63244 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RACK1P63244 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RACK1P63244 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RACK1P63244 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RACK1P63244 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RACK1P63244 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RACK1P63244 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RACK1P63244 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RACK1P63244 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RACK1P63244 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RACK1P63244 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RACK1P63244 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RACK1P63244 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RACK1P63244 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RACK1P63244 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RACK1P63244 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RACK1P63244 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RACK1P63244 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RACK1P63244 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RACK1P63244 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RACK1P63244 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RACK1P63244 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RACK1P63244 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RACK1P63244 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RACK1P63244 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RACK1P63244 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RACK1P63244 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RACK1P63244 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RACK1P63244 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RACK1P63244 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RACK1P63244 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RACK1P63244 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RACK1P63244 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RACK1P63244 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RACK1P63244 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RACK1P63244 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RACK1P63244 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RACK1P63244 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RACK1P63244 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RACK1P63244 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RACK1P63244 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RACK1P63244 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RACK1P63244 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RACK1P63244 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RACK1P63244 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RACK1P63244 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RACK1P63244 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RACK1P63244 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RACK1P63244 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RACK1P63244 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RACK1P63244 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RACK1P63244 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RACK1P63244 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RACK1P63244 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RACK1P63244 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RACK1P63244 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RACK1P63244 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RACK1P63244 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RACK1P63244 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RACK1P63244 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RACK1P63244 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RACK1P63244 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RACK1P63244 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RACK1P63244 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RACK1P63244 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RACK1P63244 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RACK1P63244 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
RACK1P63244 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RACK1P63244 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RACK1P63244 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RACK1P63244 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RACK1P63244 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RACK1P63244 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RACK1P63244 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RACK1P63244 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RACK1P63244 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RACK1P63244 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RACK1P63244 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RACK1P63244 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RACK1P63244 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RACK1P63244 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RACK1P63244 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RACK1P63244 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RACK1P63244 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RACK1P63244 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RACK1P63244 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RACK1P63244 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RACK1P63244 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RACK1P63244 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms