Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMO4P61968 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMO4P61968 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMO4P61968 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMO4P61968 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMO4P61968 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
LMO4P61968 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMO4P61968 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMO4P61968 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMO4P61968 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMO4P61968 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMO4P61968 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMO4P61968 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMO4P61968 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMO4P61968 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMO4P61968 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMO4P61968 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMO4P61968 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMO4P61968 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMO4P61968 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMO4P61968 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMO4P61968 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMO4P61968 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMO4P61968 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMO4P61968 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMO4P61968 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMO4P61968 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMO4P61968 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMO4P61968 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMO4P61968 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
LMO4P61968 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LMO4P61968 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LMO4P61968 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LMO4P61968 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMO4P61968 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMO4P61968 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMO4P61968 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMO4P61968 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
LMO4P61968 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMO4P61968 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMO4P61968 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMO4P61968 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMO4P61968 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMO4P61968 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMO4P61968 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LMO4P61968 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LMO4P61968 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LMO4P61968 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LMO4P61968 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
LMO4P61968 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LMO4P61968 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LMO4P61968 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
LMO4P61968 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
LMO4P61968 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LMO4P61968 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LMO4P61968 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LMO4P61968 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LMO4P61968 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LMO4P61968 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LMO4P61968 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LMO4P61968 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LMO4P61968 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LMO4P61968 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LMO4P61968 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LMO4P61968 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LMO4P61968 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LMO4P61968 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LMO4P61968 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LMO4P61968 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LMO4P61968 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LMO4P61968 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LMO4P61968 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LMO4P61968 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
LMO4P61968 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
LMO4P61968 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LMO4P61968 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LMO4P61968 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LMO4P61968 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LMO4P61968 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LMO4P61968 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
LMO4P61968 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LMO4P61968 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LMO4P61968 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
LMO4P61968 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LMO4P61968 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
LMO4P61968 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
LMO4P61968 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LMO4P61968 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LMO4P61968 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LMO4P61968 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LMO4P61968 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LMO4P61968 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LMO4P61968 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LMO4P61968 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LMO4P61968 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LMO4P61968 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LMO4P61968 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LMO4P61968 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LMO4P61968 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LMO4P61968 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms