Protein–RNA interactions for Protein: P61158

ACTR3, Actin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR3P61158 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACTR3P61158 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACTR3P61158 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACTR3P61158 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACTR3P61158 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACTR3P61158 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACTR3P61158 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACTR3P61158 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACTR3P61158 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACTR3P61158 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACTR3P61158 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACTR3P61158 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACTR3P61158 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACTR3P61158 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACTR3P61158 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACTR3P61158 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACTR3P61158 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ACTR3P61158 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACTR3P61158 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ACTR3P61158 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACTR3P61158 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACTR3P61158 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACTR3P61158 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACTR3P61158 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACTR3P61158 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTR3P61158 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTR3P61158 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTR3P61158 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTR3P61158 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTR3P61158 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTR3P61158 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTR3P61158 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTR3P61158 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTR3P61158 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTR3P61158 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ACTR3P61158 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACTR3P61158 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ACTR3P61158 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACTR3P61158 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACTR3P61158 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACTR3P61158 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACTR3P61158 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACTR3P61158 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACTR3P61158 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACTR3P61158 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACTR3P61158 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACTR3P61158 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACTR3P61158 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTR3P61158 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTR3P61158 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTR3P61158 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACTR3P61158 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACTR3P61158 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACTR3P61158 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ACTR3P61158 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACTR3P61158 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACTR3P61158 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACTR3P61158 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACTR3P61158 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACTR3P61158 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACTR3P61158 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACTR3P61158 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACTR3P61158 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACTR3P61158 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ACTR3P61158 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACTR3P61158 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACTR3P61158 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACTR3P61158 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACTR3P61158 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACTR3P61158 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACTR3P61158 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACTR3P61158 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ACTR3P61158 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACTR3P61158 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACTR3P61158 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACTR3P61158 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACTR3P61158 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ACTR3P61158 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACTR3P61158 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACTR3P61158 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACTR3P61158 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTR3P61158 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTR3P61158 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTR3P61158 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTR3P61158 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTR3P61158 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACTR3P61158 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACTR3P61158 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACTR3P61158 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACTR3P61158 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACTR3P61158 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACTR3P61158 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACTR3P61158 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACTR3P61158 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACTR3P61158 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACTR3P61158 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACTR3P61158 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACTR3P61158 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ACTR3P61158 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ACTR3P61158 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms