Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ERVPABLB-1P60509 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ERVPABLB-1P60509 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ERVPABLB-1P60509 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ERVPABLB-1P60509 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ERVPABLB-1P60509 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ERVPABLB-1P60509 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ERVPABLB-1P60509 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ERVPABLB-1P60509 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ERVPABLB-1P60509 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ERVPABLB-1P60509 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ERVPABLB-1P60509 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ERVPABLB-1P60509 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ERVPABLB-1P60509 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ERVPABLB-1P60509 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERVPABLB-1P60509 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERVPABLB-1P60509 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERVPABLB-1P60509 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERVPABLB-1P60509 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERVPABLB-1P60509 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERVPABLB-1P60509 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERVPABLB-1P60509 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERVPABLB-1P60509 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERVPABLB-1P60509 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERVPABLB-1P60509 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERVPABLB-1P60509 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERVPABLB-1P60509 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERVPABLB-1P60509 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERVPABLB-1P60509 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ERVPABLB-1P60509 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ERVPABLB-1P60509 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ERVPABLB-1P60509 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ERVPABLB-1P60509 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ERVPABLB-1P60509 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ERVPABLB-1P60509 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ERVPABLB-1P60509 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ERVPABLB-1P60509 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
ERVPABLB-1P60509 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ERVPABLB-1P60509 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ERVPABLB-1P60509 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ERVPABLB-1P60509 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ERVPABLB-1P60509 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ERVPABLB-1P60509 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ERVPABLB-1P60509 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ERVPABLB-1P60509 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ERVPABLB-1P60509 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ERVPABLB-1P60509 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ERVPABLB-1P60509 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ERVPABLB-1P60509 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ERVPABLB-1P60509 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ERVPABLB-1P60509 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ERVPABLB-1P60509 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ERVPABLB-1P60509 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ERVPABLB-1P60509 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ERVPABLB-1P60509 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ERVPABLB-1P60509 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ERVPABLB-1P60509 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ERVPABLB-1P60509 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ERVPABLB-1P60509 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ERVPABLB-1P60509 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ERVPABLB-1P60509 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ERVPABLB-1P60509 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ERVPABLB-1P60509 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ERVPABLB-1P60509 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ERVPABLB-1P60509 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ERVPABLB-1P60509 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ERVPABLB-1P60509 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ERVPABLB-1P60509 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ERVPABLB-1P60509 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ERVPABLB-1P60509 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ERVPABLB-1P60509 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ERVPABLB-1P60509 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ERVPABLB-1P60509 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ERVPABLB-1P60509 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ERVPABLB-1P60509 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ERVPABLB-1P60509 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ERVPABLB-1P60509 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ERVPABLB-1P60509 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ERVPABLB-1P60509 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ERVPABLB-1P60509 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ERVPABLB-1P60509 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ERVPABLB-1P60509 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ERVPABLB-1P60509 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ERVPABLB-1P60509 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ERVPABLB-1P60509 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ERVPABLB-1P60509 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ERVPABLB-1P60509 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ERVPABLB-1P60509 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ERVPABLB-1P60509 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ERVPABLB-1P60509 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERVPABLB-1P60509 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERVPABLB-1P60509 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERVPABLB-1P60509 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERVPABLB-1P60509 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERVPABLB-1P60509 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERVPABLB-1P60509 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERVPABLB-1P60509 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERVPABLB-1P60509 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERVPABLB-1P60509 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERVPABLB-1P60509 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms