Protein–RNA interactions for Protein: P59190

RAB15, Ras-related protein Rab-15, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB15P59190 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB15P59190 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB15P59190 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB15P59190 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB15P59190 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB15P59190 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB15P59190 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB15P59190 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB15P59190 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB15P59190 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB15P59190 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB15P59190 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB15P59190 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB15P59190 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB15P59190 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB15P59190 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB15P59190 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB15P59190 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB15P59190 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB15P59190 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB15P59190 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB15P59190 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB15P59190 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB15P59190 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB15P59190 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RAB15P59190 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RAB15P59190 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RAB15P59190 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB15P59190 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB15P59190 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB15P59190 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB15P59190 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB15P59190 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB15P59190 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB15P59190 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB15P59190 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB15P59190 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB15P59190 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB15P59190 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB15P59190 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB15P59190 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB15P59190 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB15P59190 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB15P59190 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB15P59190 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB15P59190 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB15P59190 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB15P59190 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB15P59190 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB15P59190 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB15P59190 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB15P59190 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB15P59190 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB15P59190 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB15P59190 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB15P59190 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB15P59190 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB15P59190 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB15P59190 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB15P59190 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB15P59190 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB15P59190 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB15P59190 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB15P59190 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB15P59190 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB15P59190 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB15P59190 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB15P59190 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB15P59190 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB15P59190 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB15P59190 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB15P59190 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB15P59190 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RAB15P59190 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RAB15P59190 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB15P59190 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB15P59190 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB15P59190 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB15P59190 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB15P59190 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB15P59190 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB15P59190 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB15P59190 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB15P59190 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB15P59190 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB15P59190 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB15P59190 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB15P59190 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB15P59190 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB15P59190 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB15P59190 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB15P59190 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB15P59190 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB15P59190 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB15P59190 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB15P59190 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB15P59190 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB15P59190 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB15P59190 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB15P59190 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms