Protein–RNA interactions for Protein: P58872

RHBDL3, Rhomboid-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL3P58872 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RHBDL3P58872 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RHBDL3P58872 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
RHBDL3P58872 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RHBDL3P58872 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RHBDL3P58872 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RHBDL3P58872 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RHBDL3P58872 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RHBDL3P58872 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RHBDL3P58872 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RHBDL3P58872 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RHBDL3P58872 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RHBDL3P58872 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
RHBDL3P58872 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RHBDL3P58872 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RHBDL3P58872 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RHBDL3P58872 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RHBDL3P58872 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RHBDL3P58872 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RHBDL3P58872 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RHBDL3P58872 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
RHBDL3P58872 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
RHBDL3P58872 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RHBDL3P58872 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RHBDL3P58872 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RHBDL3P58872 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RHBDL3P58872 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RHBDL3P58872 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RHBDL3P58872 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RHBDL3P58872 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RHBDL3P58872 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RHBDL3P58872 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RHBDL3P58872 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RHBDL3P58872 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RHBDL3P58872 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RHBDL3P58872 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RHBDL3P58872 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RHBDL3P58872 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RHBDL3P58872 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RHBDL3P58872 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RHBDL3P58872 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RHBDL3P58872 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
RHBDL3P58872 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RHBDL3P58872 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RHBDL3P58872 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RHBDL3P58872 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
RHBDL3P58872 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
RHBDL3P58872 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RHBDL3P58872 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RHBDL3P58872 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RHBDL3P58872 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RHBDL3P58872 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
RHBDL3P58872 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RHBDL3P58872 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RHBDL3P58872 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RHBDL3P58872 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RHBDL3P58872 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RHBDL3P58872 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RHBDL3P58872 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
RHBDL3P58872 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
RHBDL3P58872 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
RHBDL3P58872 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
RHBDL3P58872 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
RHBDL3P58872 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RHBDL3P58872 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RHBDL3P58872 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RHBDL3P58872 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RHBDL3P58872 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RHBDL3P58872 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RHBDL3P58872 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RHBDL3P58872 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RHBDL3P58872 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RHBDL3P58872 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RHBDL3P58872 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RHBDL3P58872 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RHBDL3P58872 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RHBDL3P58872 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RHBDL3P58872 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RHBDL3P58872 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RHBDL3P58872 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RHBDL3P58872 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RHBDL3P58872 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RHBDL3P58872 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RHBDL3P58872 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RHBDL3P58872 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RHBDL3P58872 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RHBDL3P58872 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RHBDL3P58872 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RHBDL3P58872 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RHBDL3P58872 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RHBDL3P58872 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RHBDL3P58872 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RHBDL3P58872 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RHBDL3P58872 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RHBDL3P58872 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RHBDL3P58872 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RHBDL3P58872 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
RHBDL3P58872 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RHBDL3P58872 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RHBDL3P58872 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 242 ms