Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LOXL3P58215 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LOXL3P58215 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LOXL3P58215 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LOXL3P58215 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LOXL3P58215 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LOXL3P58215 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LOXL3P58215 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LOXL3P58215 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LOXL3P58215 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LOXL3P58215 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LOXL3P58215 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LOXL3P58215 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LOXL3P58215 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LOXL3P58215 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LOXL3P58215 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LOXL3P58215 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LOXL3P58215 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LOXL3P58215 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LOXL3P58215 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LOXL3P58215 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LOXL3P58215 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LOXL3P58215 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LOXL3P58215 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LOXL3P58215 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LOXL3P58215 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
LOXL3P58215 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
LOXL3P58215 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LOXL3P58215 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LOXL3P58215 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LOXL3P58215 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LOXL3P58215 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LOXL3P58215 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LOXL3P58215 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LOXL3P58215 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LOXL3P58215 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LOXL3P58215 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LOXL3P58215 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LOXL3P58215 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
LOXL3P58215 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LOXL3P58215 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LOXL3P58215 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LOXL3P58215 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LOXL3P58215 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LOXL3P58215 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LOXL3P58215 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LOXL3P58215 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LOXL3P58215 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LOXL3P58215 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LOXL3P58215 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LOXL3P58215 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LOXL3P58215 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LOXL3P58215 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LOXL3P58215 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LOXL3P58215 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LOXL3P58215 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LOXL3P58215 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LOXL3P58215 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LOXL3P58215 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LOXL3P58215 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LOXL3P58215 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LOXL3P58215 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LOXL3P58215 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LOXL3P58215 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LOXL3P58215 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LOXL3P58215 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LOXL3P58215 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
LOXL3P58215 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LOXL3P58215 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
LOXL3P58215 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LOXL3P58215 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
LOXL3P58215 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LOXL3P58215 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LOXL3P58215 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LOXL3P58215 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
LOXL3P58215 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LOXL3P58215 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LOXL3P58215 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LOXL3P58215 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LOXL3P58215 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
LOXL3P58215 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LOXL3P58215 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LOXL3P58215 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LOXL3P58215 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LOXL3P58215 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
LOXL3P58215 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LOXL3P58215 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LOXL3P58215 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LOXL3P58215 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LOXL3P58215 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LOXL3P58215 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LOXL3P58215 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LOXL3P58215 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
LOXL3P58215 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LOXL3P58215 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LOXL3P58215 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LOXL3P58215 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LOXL3P58215 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LOXL3P58215 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LOXL3P58215 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms