Protein–RNA interactions for Protein: P57775

FBXW4, F-box/WD repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXW4P57775 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXW4P57775 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXW4P57775 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXW4P57775 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXW4P57775 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXW4P57775 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXW4P57775 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXW4P57775 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXW4P57775 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXW4P57775 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXW4P57775 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXW4P57775 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXW4P57775 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXW4P57775 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXW4P57775 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXW4P57775 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXW4P57775 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXW4P57775 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXW4P57775 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXW4P57775 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXW4P57775 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXW4P57775 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXW4P57775 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXW4P57775 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXW4P57775 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXW4P57775 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXW4P57775 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXW4P57775 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXW4P57775 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXW4P57775 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXW4P57775 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXW4P57775 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXW4P57775 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXW4P57775 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXW4P57775 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXW4P57775 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXW4P57775 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FBXW4P57775 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FBXW4P57775 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXW4P57775 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXW4P57775 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXW4P57775 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXW4P57775 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXW4P57775 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXW4P57775 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXW4P57775 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXW4P57775 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXW4P57775 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXW4P57775 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXW4P57775 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXW4P57775 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXW4P57775 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXW4P57775 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXW4P57775 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXW4P57775 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXW4P57775 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXW4P57775 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXW4P57775 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXW4P57775 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXW4P57775 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXW4P57775 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXW4P57775 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXW4P57775 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXW4P57775 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXW4P57775 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXW4P57775 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXW4P57775 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXW4P57775 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXW4P57775 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXW4P57775 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXW4P57775 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXW4P57775 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXW4P57775 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXW4P57775 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXW4P57775 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXW4P57775 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXW4P57775 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FBXW4P57775 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FBXW4P57775 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FBXW4P57775 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXW4P57775 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXW4P57775 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXW4P57775 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXW4P57775 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXW4P57775 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXW4P57775 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXW4P57775 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXW4P57775 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXW4P57775 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXW4P57775 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXW4P57775 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXW4P57775 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXW4P57775 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXW4P57775 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXW4P57775 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXW4P57775 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXW4P57775 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXW4P57775 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXW4P57775 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXW4P57775 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 191.1 ms