Protein–RNA interactions for Protein: P56747

CLDN6, Claudin-6, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN6P56747 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDN6P56747 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDN6P56747 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDN6P56747 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDN6P56747 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDN6P56747 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDN6P56747 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDN6P56747 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLDN6P56747 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLDN6P56747 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLDN6P56747 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CLDN6P56747 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLDN6P56747 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLDN6P56747 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLDN6P56747 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN6P56747 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN6P56747 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN6P56747 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN6P56747 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN6P56747 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN6P56747 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDN6P56747 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDN6P56747 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDN6P56747 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDN6P56747 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDN6P56747 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDN6P56747 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDN6P56747 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDN6P56747 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDN6P56747 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLDN6P56747 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLDN6P56747 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLDN6P56747 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLDN6P56747 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLDN6P56747 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLDN6P56747 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLDN6P56747 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLDN6P56747 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLDN6P56747 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLDN6P56747 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLDN6P56747 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLDN6P56747 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLDN6P56747 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLDN6P56747 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLDN6P56747 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLDN6P56747 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLDN6P56747 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLDN6P56747 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLDN6P56747 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CLDN6P56747 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLDN6P56747 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLDN6P56747 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLDN6P56747 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLDN6P56747 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLDN6P56747 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLDN6P56747 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLDN6P56747 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLDN6P56747 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLDN6P56747 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLDN6P56747 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLDN6P56747 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLDN6P56747 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLDN6P56747 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLDN6P56747 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLDN6P56747 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLDN6P56747 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLDN6P56747 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLDN6P56747 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLDN6P56747 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLDN6P56747 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLDN6P56747 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLDN6P56747 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLDN6P56747 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLDN6P56747 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLDN6P56747 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLDN6P56747 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLDN6P56747 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLDN6P56747 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CLDN6P56747 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CLDN6P56747 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CLDN6P56747 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CLDN6P56747 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLDN6P56747 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLDN6P56747 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CLDN6P56747 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLDN6P56747 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLDN6P56747 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLDN6P56747 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLDN6P56747 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLDN6P56747 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLDN6P56747 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLDN6P56747 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLDN6P56747 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLDN6P56747 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLDN6P56747 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLDN6P56747 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLDN6P56747 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLDN6P56747 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLDN6P56747 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLDN6P56747 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms