Protein–RNA interactions for Protein: P55145

MANF, Mesencephalic astrocyte-derived neurotrophic factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MANFP55145 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MANFP55145 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MANFP55145 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MANFP55145 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MANFP55145 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MANFP55145 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MANFP55145 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MANFP55145 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MANFP55145 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MANFP55145 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MANFP55145 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MANFP55145 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MANFP55145 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MANFP55145 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MANFP55145 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MANFP55145 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MANFP55145 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MANFP55145 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MANFP55145 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MANFP55145 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MANFP55145 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MANFP55145 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MANFP55145 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MANFP55145 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MANFP55145 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MANFP55145 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MANFP55145 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MANFP55145 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MANFP55145 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MANFP55145 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MANFP55145 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MANFP55145 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MANFP55145 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MANFP55145 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MANFP55145 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MANFP55145 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MANFP55145 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MANFP55145 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MANFP55145 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MANFP55145 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MANFP55145 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MANFP55145 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MANFP55145 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MANFP55145 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
MANFP55145 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MANFP55145 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MANFP55145 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MANFP55145 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MANFP55145 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MANFP55145 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MANFP55145 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MANFP55145 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MANFP55145 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MANFP55145 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MANFP55145 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MANFP55145 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MANFP55145 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MANFP55145 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MANFP55145 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MANFP55145 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MANFP55145 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MANFP55145 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MANFP55145 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MANFP55145 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MANFP55145 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MANFP55145 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MANFP55145 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MANFP55145 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MANFP55145 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MANFP55145 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MANFP55145 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MANFP55145 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MANFP55145 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MANFP55145 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MANFP55145 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MANFP55145 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MANFP55145 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MANFP55145 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MANFP55145 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MANFP55145 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MANFP55145 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MANFP55145 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MANFP55145 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MANFP55145 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MANFP55145 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MANFP55145 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MANFP55145 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MANFP55145 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MANFP55145 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MANFP55145 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MANFP55145 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MANFP55145 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MANFP55145 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MANFP55145 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MANFP55145 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MANFP55145 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MANFP55145 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MANFP55145 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MANFP55145 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MANFP55145 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms