Protein–RNA interactions for Protein: P54753

EPHB3, Ephrin type-B receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB3P54753 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
EPHB3P54753 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
EPHB3P54753 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EPHB3P54753 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
EPHB3P54753 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
EPHB3P54753 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EPHB3P54753 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EPHB3P54753 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EPHB3P54753 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EPHB3P54753 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EPHB3P54753 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EPHB3P54753 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EPHB3P54753 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EPHB3P54753 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EPHB3P54753 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EPHB3P54753 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EPHB3P54753 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EPHB3P54753 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EPHB3P54753 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
EPHB3P54753 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EPHB3P54753 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
EPHB3P54753 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
EPHB3P54753 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EPHB3P54753 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EPHB3P54753 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EPHB3P54753 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EPHB3P54753 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EPHB3P54753 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EPHB3P54753 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EPHB3P54753 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EPHB3P54753 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EPHB3P54753 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
EPHB3P54753 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EPHB3P54753 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EPHB3P54753 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EPHB3P54753 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
EPHB3P54753 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
EPHB3P54753 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
EPHB3P54753 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EPHB3P54753 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EPHB3P54753 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EPHB3P54753 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EPHB3P54753 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EPHB3P54753 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
EPHB3P54753 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EPHB3P54753 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EPHB3P54753 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EPHB3P54753 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EPHB3P54753 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
EPHB3P54753 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EPHB3P54753 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
EPHB3P54753 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EPHB3P54753 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EPHB3P54753 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EPHB3P54753 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EPHB3P54753 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EPHB3P54753 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EPHB3P54753 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
EPHB3P54753 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EPHB3P54753 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EPHB3P54753 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EPHB3P54753 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EPHB3P54753 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EPHB3P54753 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EPHB3P54753 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EPHB3P54753 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EPHB3P54753 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EPHB3P54753 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EPHB3P54753 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EPHB3P54753 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EPHB3P54753 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EPHB3P54753 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EPHB3P54753 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EPHB3P54753 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
EPHB3P54753 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EPHB3P54753 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EPHB3P54753 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EPHB3P54753 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EPHB3P54753 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
EPHB3P54753 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EPHB3P54753 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EPHB3P54753 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EPHB3P54753 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EPHB3P54753 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EPHB3P54753 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EPHB3P54753 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EPHB3P54753 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EPHB3P54753 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EPHB3P54753 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EPHB3P54753 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EPHB3P54753 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EPHB3P54753 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EPHB3P54753 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EPHB3P54753 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EPHB3P54753 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EPHB3P54753 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EPHB3P54753 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EPHB3P54753 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EPHB3P54753 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EPHB3P54753 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms