Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
COPAP53621 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COPAP53621 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
COPAP53621 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COPAP53621 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COPAP53621 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COPAP53621 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COPAP53621 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COPAP53621 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COPAP53621 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COPAP53621 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COPAP53621 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COPAP53621 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COPAP53621 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
COPAP53621 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COPAP53621 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
COPAP53621 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COPAP53621 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COPAP53621 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
COPAP53621 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COPAP53621 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
COPAP53621 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
COPAP53621 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
COPAP53621 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
COPAP53621 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
COPAP53621 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
COPAP53621 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
COPAP53621 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COPAP53621 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
COPAP53621 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
COPAP53621 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COPAP53621 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COPAP53621 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COPAP53621 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COPAP53621 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COPAP53621 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COPAP53621 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COPAP53621 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COPAP53621 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
COPAP53621 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
COPAP53621 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COPAP53621 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COPAP53621 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COPAP53621 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COPAP53621 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COPAP53621 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COPAP53621 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COPAP53621 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COPAP53621 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COPAP53621 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
COPAP53621 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
COPAP53621 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COPAP53621 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COPAP53621 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COPAP53621 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COPAP53621 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COPAP53621 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COPAP53621 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COPAP53621 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COPAP53621 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COPAP53621 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COPAP53621 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COPAP53621 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COPAP53621 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COPAP53621 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COPAP53621 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COPAP53621 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COPAP53621 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COPAP53621 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
COPAP53621 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
COPAP53621 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COPAP53621 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COPAP53621 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
COPAP53621 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COPAP53621 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COPAP53621 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COPAP53621 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
COPAP53621 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COPAP53621 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COPAP53621 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
COPAP53621 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COPAP53621 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COPAP53621 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COPAP53621 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COPAP53621 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
COPAP53621 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
COPAP53621 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
COPAP53621 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COPAP53621 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COPAP53621 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COPAP53621 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COPAP53621 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COPAP53621 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COPAP53621 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COPAP53621 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COPAP53621 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COPAP53621 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
COPAP53621 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
COPAP53621 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
COPAP53621 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms