Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FOSBP53539 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FOSBP53539 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FOSBP53539 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FOSBP53539 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
FOSBP53539 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FOSBP53539 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FOSBP53539 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FOSBP53539 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FOSBP53539 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FOSBP53539 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
FOSBP53539 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FOSBP53539 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FOSBP53539 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FOSBP53539 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FOSBP53539 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FOSBP53539 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FOSBP53539 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FOSBP53539 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FOSBP53539 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FOSBP53539 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
FOSBP53539 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
FOSBP53539 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
FOSBP53539 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
FOSBP53539 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.09
FOSBP53539 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FOSBP53539 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FOSBP53539 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FOSBP53539 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
FOSBP53539 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
FOSBP53539 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FOSBP53539 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FOSBP53539 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
FOSBP53539 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FOSBP53539 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
FOSBP53539 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FOSBP53539 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
FOSBP53539 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FOSBP53539 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
FOSBP53539 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FOSBP53539 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FOSBP53539 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FOSBP53539 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FOSBP53539 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FOSBP53539 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FOSBP53539 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FOSBP53539 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FOSBP53539 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FOSBP53539 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FOSBP53539 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FOSBP53539 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FOSBP53539 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FOSBP53539 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FOSBP53539 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FOSBP53539 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FOSBP53539 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
FOSBP53539 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FOSBP53539 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FOSBP53539 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FOSBP53539 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FOSBP53539 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FOSBP53539 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
FOSBP53539 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FOSBP53539 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FOSBP53539 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
FOSBP53539 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FOSBP53539 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FOSBP53539 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FOSBP53539 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FOSBP53539 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FOSBP53539 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FOSBP53539 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FOSBP53539 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FOSBP53539 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FOSBP53539 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FOSBP53539 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FOSBP53539 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
FOSBP53539 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FOSBP53539 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
FOSBP53539 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
FOSBP53539 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FOSBP53539 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FOSBP53539 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
FOSBP53539 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FOSBP53539 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FOSBP53539 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FOSBP53539 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.01■■■□□ 2.08
FOSBP53539 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
FOSBP53539 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
FOSBP53539 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
FOSBP53539 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
FOSBP53539 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FOSBP53539 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
FOSBP53539 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
FOSBP53539 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
FOSBP53539 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FOSBP53539 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FOSBP53539 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
FOSBP53539 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
FOSBP53539 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms