Protein–RNA interactions for Protein: P52790

HK3, Hexokinase-3, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HK3P52790 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HK3P52790 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HK3P52790 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HK3P52790 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HK3P52790 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HK3P52790 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HK3P52790 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HK3P52790 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HK3P52790 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HK3P52790 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HK3P52790 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HK3P52790 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
HK3P52790 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HK3P52790 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HK3P52790 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HK3P52790 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HK3P52790 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HK3P52790 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
HK3P52790 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HK3P52790 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HK3P52790 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HK3P52790 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HK3P52790 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HK3P52790 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HK3P52790 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HK3P52790 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HK3P52790 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HK3P52790 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
HK3P52790 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HK3P52790 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
HK3P52790 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HK3P52790 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HK3P52790 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HK3P52790 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HK3P52790 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HK3P52790 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HK3P52790 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HK3P52790 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HK3P52790 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HK3P52790 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HK3P52790 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HK3P52790 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HK3P52790 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HK3P52790 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HK3P52790 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HK3P52790 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
HK3P52790 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HK3P52790 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HK3P52790 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HK3P52790 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HK3P52790 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HK3P52790 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HK3P52790 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HK3P52790 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HK3P52790 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HK3P52790 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HK3P52790 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HK3P52790 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HK3P52790 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HK3P52790 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HK3P52790 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HK3P52790 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HK3P52790 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HK3P52790 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HK3P52790 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HK3P52790 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HK3P52790 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HK3P52790 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HK3P52790 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HK3P52790 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HK3P52790 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HK3P52790 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HK3P52790 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HK3P52790 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HK3P52790 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
HK3P52790 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HK3P52790 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HK3P52790 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HK3P52790 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HK3P52790 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HK3P52790 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HK3P52790 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HK3P52790 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HK3P52790 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HK3P52790 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HK3P52790 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HK3P52790 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
HK3P52790 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HK3P52790 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
HK3P52790 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HK3P52790 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HK3P52790 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HK3P52790 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HK3P52790 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HK3P52790 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HK3P52790 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HK3P52790 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HK3P52790 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HK3P52790 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HK3P52790 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms