Protein–RNA interactions for Protein: P51946

CCNH, Cyclin-H, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNHP51946 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CCNHP51946 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCNHP51946 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCNHP51946 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCNHP51946 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCNHP51946 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCNHP51946 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNHP51946 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNHP51946 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNHP51946 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNHP51946 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNHP51946 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNHP51946 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNHP51946 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNHP51946 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCNHP51946 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CCNHP51946 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCNHP51946 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCNHP51946 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCNHP51946 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCNHP51946 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCNHP51946 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCNHP51946 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCNHP51946 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCNHP51946 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CCNHP51946 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCNHP51946 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCNHP51946 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCNHP51946 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCNHP51946 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCNHP51946 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCNHP51946 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCNHP51946 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCNHP51946 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCNHP51946 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCNHP51946 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCNHP51946 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCNHP51946 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCNHP51946 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCNHP51946 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCNHP51946 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCNHP51946 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCNHP51946 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCNHP51946 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCNHP51946 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCNHP51946 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCNHP51946 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCNHP51946 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCNHP51946 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCNHP51946 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CCNHP51946 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCNHP51946 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCNHP51946 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCNHP51946 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCNHP51946 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCNHP51946 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCNHP51946 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCNHP51946 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCNHP51946 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCNHP51946 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCNHP51946 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCNHP51946 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CCNHP51946 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCNHP51946 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCNHP51946 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCNHP51946 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCNHP51946 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCNHP51946 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCNHP51946 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCNHP51946 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCNHP51946 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CCNHP51946 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCNHP51946 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CCNHP51946 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCNHP51946 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCNHP51946 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCNHP51946 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCNHP51946 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CCNHP51946 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCNHP51946 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCNHP51946 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCNHP51946 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCNHP51946 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCNHP51946 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCNHP51946 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCNHP51946 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCNHP51946 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCNHP51946 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCNHP51946 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCNHP51946 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCNHP51946 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCNHP51946 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCNHP51946 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCNHP51946 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCNHP51946 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCNHP51946 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCNHP51946 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCNHP51946 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCNHP51946 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCNHP51946 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms