Protein–RNA interactions for Protein: P51884

LUM, Lumican, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LUMP51884 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LUMP51884 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LUMP51884 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LUMP51884 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LUMP51884 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
LUMP51884 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LUMP51884 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LUMP51884 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LUMP51884 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LUMP51884 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LUMP51884 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LUMP51884 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LUMP51884 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LUMP51884 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LUMP51884 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LUMP51884 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LUMP51884 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LUMP51884 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LUMP51884 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LUMP51884 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
LUMP51884 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LUMP51884 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LUMP51884 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
LUMP51884 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LUMP51884 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LUMP51884 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LUMP51884 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LUMP51884 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LUMP51884 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LUMP51884 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LUMP51884 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LUMP51884 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
LUMP51884 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LUMP51884 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LUMP51884 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LUMP51884 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LUMP51884 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LUMP51884 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LUMP51884 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LUMP51884 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LUMP51884 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LUMP51884 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LUMP51884 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LUMP51884 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LUMP51884 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
LUMP51884 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LUMP51884 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LUMP51884 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LUMP51884 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LUMP51884 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LUMP51884 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
LUMP51884 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LUMP51884 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LUMP51884 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LUMP51884 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LUMP51884 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LUMP51884 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LUMP51884 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LUMP51884 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LUMP51884 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LUMP51884 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LUMP51884 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LUMP51884 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LUMP51884 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LUMP51884 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LUMP51884 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LUMP51884 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LUMP51884 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LUMP51884 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LUMP51884 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LUMP51884 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LUMP51884 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LUMP51884 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LUMP51884 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LUMP51884 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LUMP51884 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LUMP51884 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LUMP51884 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LUMP51884 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LUMP51884 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LUMP51884 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LUMP51884 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LUMP51884 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LUMP51884 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LUMP51884 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
LUMP51884 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LUMP51884 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LUMP51884 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LUMP51884 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LUMP51884 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LUMP51884 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LUMP51884 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LUMP51884 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LUMP51884 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LUMP51884 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LUMP51884 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LUMP51884 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LUMP51884 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LUMP51884 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LUMP51884 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms