Protein–RNA interactions for Protein: P51805

PLXNA3, Plexin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 1,871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA3P51805 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PLXNA3P51805 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PLXNA3P51805 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PLXNA3P51805 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PLXNA3P51805 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PLXNA3P51805 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PLXNA3P51805 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PLXNA3P51805 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PLXNA3P51805 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PLXNA3P51805 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PLXNA3P51805 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PLXNA3P51805 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PLXNA3P51805 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PLXNA3P51805 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PLXNA3P51805 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PLXNA3P51805 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PLXNA3P51805 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PLXNA3P51805 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PLXNA3P51805 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PLXNA3P51805 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PLXNA3P51805 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PLXNA3P51805 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PLXNA3P51805 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PLXNA3P51805 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PLXNA3P51805 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PLXNA3P51805 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PLXNA3P51805 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PLXNA3P51805 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PLXNA3P51805 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PLXNA3P51805 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PLXNA3P51805 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PLXNA3P51805 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PLXNA3P51805 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PLXNA3P51805 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PLXNA3P51805 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PLXNA3P51805 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PLXNA3P51805 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PLXNA3P51805 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PLXNA3P51805 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PLXNA3P51805 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PLXNA3P51805 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PLXNA3P51805 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PLXNA3P51805 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PLXNA3P51805 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PLXNA3P51805 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PLXNA3P51805 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PLXNA3P51805 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PLXNA3P51805 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PLXNA3P51805 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PLXNA3P51805 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PLXNA3P51805 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PLXNA3P51805 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PLXNA3P51805 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PLXNA3P51805 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PLXNA3P51805 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PLXNA3P51805 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PLXNA3P51805 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PLXNA3P51805 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PLXNA3P51805 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PLXNA3P51805 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PLXNA3P51805 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PLXNA3P51805 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PLXNA3P51805 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PLXNA3P51805 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PLXNA3P51805 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PLXNA3P51805 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PLXNA3P51805 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PLXNA3P51805 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PLXNA3P51805 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PLXNA3P51805 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PLXNA3P51805 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PLXNA3P51805 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PLXNA3P51805 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PLXNA3P51805 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PLXNA3P51805 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PLXNA3P51805 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PLXNA3P51805 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PLXNA3P51805 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PLXNA3P51805 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PLXNA3P51805 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PLXNA3P51805 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PLXNA3P51805 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PLXNA3P51805 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PLXNA3P51805 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
PLXNA3P51805 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PLXNA3P51805 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PLXNA3P51805 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PLXNA3P51805 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PLXNA3P51805 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PLXNA3P51805 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PLXNA3P51805 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PLXNA3P51805 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PLXNA3P51805 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PLXNA3P51805 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PLXNA3P51805 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PLXNA3P51805 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PLXNA3P51805 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PLXNA3P51805 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PLXNA3P51805 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PLXNA3P51805 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms