Protein–RNA interactions for Protein: P51449

RORC, Nuclear receptor ROR-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORCP51449 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RORCP51449 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RORCP51449 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RORCP51449 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
RORCP51449 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RORCP51449 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RORCP51449 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RORCP51449 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RORCP51449 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RORCP51449 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RORCP51449 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RORCP51449 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RORCP51449 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RORCP51449 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RORCP51449 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
RORCP51449 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RORCP51449 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RORCP51449 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RORCP51449 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RORCP51449 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RORCP51449 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RORCP51449 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RORCP51449 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RORCP51449 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RORCP51449 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RORCP51449 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RORCP51449 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RORCP51449 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RORCP51449 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RORCP51449 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RORCP51449 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RORCP51449 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
RORCP51449 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
RORCP51449 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RORCP51449 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RORCP51449 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RORCP51449 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RORCP51449 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RORCP51449 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RORCP51449 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RORCP51449 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RORCP51449 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RORCP51449 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RORCP51449 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RORCP51449 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RORCP51449 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RORCP51449 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RORCP51449 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RORCP51449 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RORCP51449 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RORCP51449 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RORCP51449 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RORCP51449 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RORCP51449 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RORCP51449 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RORCP51449 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RORCP51449 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RORCP51449 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RORCP51449 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RORCP51449 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RORCP51449 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RORCP51449 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RORCP51449 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RORCP51449 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RORCP51449 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RORCP51449 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RORCP51449 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RORCP51449 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RORCP51449 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RORCP51449 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RORCP51449 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RORCP51449 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RORCP51449 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RORCP51449 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RORCP51449 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RORCP51449 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RORCP51449 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
RORCP51449 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RORCP51449 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RORCP51449 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RORCP51449 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RORCP51449 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RORCP51449 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RORCP51449 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RORCP51449 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RORCP51449 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RORCP51449 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RORCP51449 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RORCP51449 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RORCP51449 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RORCP51449 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RORCP51449 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RORCP51449 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RORCP51449 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RORCP51449 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RORCP51449 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RORCP51449 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RORCP51449 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RORCP51449 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RORCP51449 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms