Protein–RNA interactions for Protein: P51168

SCNN1B, Amiloride-sensitive sodium channel subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCNN1BP51168 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCNN1BP51168 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SCNN1BP51168 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SCNN1BP51168 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCNN1BP51168 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCNN1BP51168 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCNN1BP51168 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCNN1BP51168 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCNN1BP51168 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SCNN1BP51168 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCNN1BP51168 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCNN1BP51168 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCNN1BP51168 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCNN1BP51168 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCNN1BP51168 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCNN1BP51168 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCNN1BP51168 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCNN1BP51168 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCNN1BP51168 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCNN1BP51168 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCNN1BP51168 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCNN1BP51168 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCNN1BP51168 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCNN1BP51168 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SCNN1BP51168 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCNN1BP51168 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCNN1BP51168 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCNN1BP51168 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCNN1BP51168 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCNN1BP51168 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCNN1BP51168 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCNN1BP51168 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCNN1BP51168 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCNN1BP51168 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCNN1BP51168 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCNN1BP51168 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCNN1BP51168 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCNN1BP51168 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCNN1BP51168 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCNN1BP51168 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCNN1BP51168 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCNN1BP51168 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCNN1BP51168 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCNN1BP51168 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCNN1BP51168 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SCNN1BP51168 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCNN1BP51168 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCNN1BP51168 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCNN1BP51168 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCNN1BP51168 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCNN1BP51168 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCNN1BP51168 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCNN1BP51168 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCNN1BP51168 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCNN1BP51168 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCNN1BP51168 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCNN1BP51168 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCNN1BP51168 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCNN1BP51168 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCNN1BP51168 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCNN1BP51168 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCNN1BP51168 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCNN1BP51168 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCNN1BP51168 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCNN1BP51168 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCNN1BP51168 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCNN1BP51168 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCNN1BP51168 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCNN1BP51168 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCNN1BP51168 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCNN1BP51168 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCNN1BP51168 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCNN1BP51168 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCNN1BP51168 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SCNN1BP51168 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCNN1BP51168 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCNN1BP51168 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCNN1BP51168 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SCNN1BP51168 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCNN1BP51168 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCNN1BP51168 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCNN1BP51168 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCNN1BP51168 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCNN1BP51168 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCNN1BP51168 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCNN1BP51168 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCNN1BP51168 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCNN1BP51168 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCNN1BP51168 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCNN1BP51168 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCNN1BP51168 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCNN1BP51168 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCNN1BP51168 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCNN1BP51168 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCNN1BP51168 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCNN1BP51168 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCNN1BP51168 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCNN1BP51168 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SCNN1BP51168 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCNN1BP51168 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms