Protein–RNA interactions for Protein: P50993

ATP1A2, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A2P50993 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP1A2P50993 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP1A2P50993 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP1A2P50993 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP1A2P50993 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP1A2P50993 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP1A2P50993 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP1A2P50993 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP1A2P50993 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP1A2P50993 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP1A2P50993 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP1A2P50993 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP1A2P50993 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP1A2P50993 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP1A2P50993 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP1A2P50993 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP1A2P50993 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP1A2P50993 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP1A2P50993 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP1A2P50993 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP1A2P50993 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP1A2P50993 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP1A2P50993 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP1A2P50993 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP1A2P50993 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP1A2P50993 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP1A2P50993 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP1A2P50993 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP1A2P50993 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP1A2P50993 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP1A2P50993 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP1A2P50993 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP1A2P50993 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP1A2P50993 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP1A2P50993 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP1A2P50993 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP1A2P50993 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP1A2P50993 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATP1A2P50993 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATP1A2P50993 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATP1A2P50993 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATP1A2P50993 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP1A2P50993 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP1A2P50993 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP1A2P50993 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP1A2P50993 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP1A2P50993 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP1A2P50993 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP1A2P50993 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP1A2P50993 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP1A2P50993 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP1A2P50993 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP1A2P50993 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP1A2P50993 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP1A2P50993 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP1A2P50993 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP1A2P50993 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP1A2P50993 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP1A2P50993 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP1A2P50993 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP1A2P50993 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP1A2P50993 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP1A2P50993 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP1A2P50993 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP1A2P50993 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP1A2P50993 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP1A2P50993 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP1A2P50993 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP1A2P50993 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP1A2P50993 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP1A2P50993 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP1A2P50993 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP1A2P50993 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP1A2P50993 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP1A2P50993 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP1A2P50993 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP1A2P50993 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ATP1A2P50993 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP1A2P50993 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP1A2P50993 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP1A2P50993 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP1A2P50993 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP1A2P50993 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP1A2P50993 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP1A2P50993 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP1A2P50993 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP1A2P50993 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP1A2P50993 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP1A2P50993 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP1A2P50993 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP1A2P50993 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP1A2P50993 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP1A2P50993 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP1A2P50993 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP1A2P50993 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP1A2P50993 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP1A2P50993 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP1A2P50993 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP1A2P50993 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP1A2P50993 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms