Protein–RNA interactions for Protein: P50750

CDK9, Cyclin-dependent kinase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK9P50750 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK9P50750 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK9P50750 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK9P50750 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK9P50750 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK9P50750 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK9P50750 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK9P50750 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK9P50750 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK9P50750 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK9P50750 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK9P50750 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK9P50750 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK9P50750 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK9P50750 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK9P50750 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK9P50750 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK9P50750 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK9P50750 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK9P50750 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK9P50750 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK9P50750 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK9P50750 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK9P50750 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK9P50750 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK9P50750 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK9P50750 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK9P50750 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK9P50750 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDK9P50750 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDK9P50750 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDK9P50750 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDK9P50750 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDK9P50750 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDK9P50750 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDK9P50750 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDK9P50750 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK9P50750 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK9P50750 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK9P50750 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK9P50750 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK9P50750 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK9P50750 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK9P50750 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK9P50750 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK9P50750 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK9P50750 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK9P50750 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK9P50750 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK9P50750 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK9P50750 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK9P50750 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK9P50750 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK9P50750 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK9P50750 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDK9P50750 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDK9P50750 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDK9P50750 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CDK9P50750 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDK9P50750 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDK9P50750 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDK9P50750 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDK9P50750 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDK9P50750 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDK9P50750 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDK9P50750 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDK9P50750 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDK9P50750 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDK9P50750 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDK9P50750 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDK9P50750 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDK9P50750 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDK9P50750 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDK9P50750 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDK9P50750 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDK9P50750 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDK9P50750 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDK9P50750 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDK9P50750 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDK9P50750 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDK9P50750 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDK9P50750 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDK9P50750 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDK9P50750 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDK9P50750 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDK9P50750 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CDK9P50750 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDK9P50750 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CDK9P50750 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CDK9P50750 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDK9P50750 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDK9P50750 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDK9P50750 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDK9P50750 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDK9P50750 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK9P50750 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK9P50750 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK9P50750 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK9P50750 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK9P50750 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms