Protein–RNA interactions for Protein: P48552

NRIP1, Nuclear receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP1P48552 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NRIP1P48552 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NRIP1P48552 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
NRIP1P48552 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NRIP1P48552 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NRIP1P48552 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NRIP1P48552 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NRIP1P48552 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NRIP1P48552 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
NRIP1P48552 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NRIP1P48552 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NRIP1P48552 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NRIP1P48552 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NRIP1P48552 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NRIP1P48552 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NRIP1P48552 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NRIP1P48552 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
NRIP1P48552 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NRIP1P48552 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NRIP1P48552 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NRIP1P48552 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NRIP1P48552 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NRIP1P48552 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NRIP1P48552 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NRIP1P48552 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NRIP1P48552 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NRIP1P48552 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NRIP1P48552 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NRIP1P48552 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NRIP1P48552 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NRIP1P48552 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NRIP1P48552 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NRIP1P48552 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NRIP1P48552 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NRIP1P48552 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NRIP1P48552 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NRIP1P48552 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NRIP1P48552 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NRIP1P48552 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NRIP1P48552 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NRIP1P48552 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NRIP1P48552 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NRIP1P48552 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NRIP1P48552 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NRIP1P48552 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NRIP1P48552 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NRIP1P48552 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NRIP1P48552 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NRIP1P48552 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NRIP1P48552 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NRIP1P48552 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NRIP1P48552 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NRIP1P48552 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NRIP1P48552 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NRIP1P48552 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NRIP1P48552 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NRIP1P48552 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NRIP1P48552 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NRIP1P48552 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NRIP1P48552 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
NRIP1P48552 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NRIP1P48552 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NRIP1P48552 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NRIP1P48552 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NRIP1P48552 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NRIP1P48552 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NRIP1P48552 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NRIP1P48552 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NRIP1P48552 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NRIP1P48552 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NRIP1P48552 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NRIP1P48552 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NRIP1P48552 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NRIP1P48552 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NRIP1P48552 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NRIP1P48552 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NRIP1P48552 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NRIP1P48552 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NRIP1P48552 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
NRIP1P48552 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
NRIP1P48552 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NRIP1P48552 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NRIP1P48552 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NRIP1P48552 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
NRIP1P48552 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NRIP1P48552 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NRIP1P48552 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NRIP1P48552 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NRIP1P48552 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NRIP1P48552 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NRIP1P48552 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NRIP1P48552 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NRIP1P48552 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NRIP1P48552 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NRIP1P48552 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NRIP1P48552 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NRIP1P48552 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NRIP1P48552 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
NRIP1P48552 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NRIP1P48552 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms