Protein–RNA interactions for Protein: P48449

LSS, Lanosterol synthase, humanhuman

Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSSP48449 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LSSP48449 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LSSP48449 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LSSP48449 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LSSP48449 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LSSP48449 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LSSP48449 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LSSP48449 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LSSP48449 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LSSP48449 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LSSP48449 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LSSP48449 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
LSSP48449 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LSSP48449 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LSSP48449 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LSSP48449 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LSSP48449 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LSSP48449 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LSSP48449 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LSSP48449 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
LSSP48449 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LSSP48449 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LSSP48449 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LSSP48449 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LSSP48449 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LSSP48449 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LSSP48449 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LSSP48449 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LSSP48449 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LSSP48449 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LSSP48449 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LSSP48449 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LSSP48449 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LSSP48449 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LSSP48449 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LSSP48449 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LSSP48449 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LSSP48449 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LSSP48449 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LSSP48449 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LSSP48449 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LSSP48449 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LSSP48449 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LSSP48449 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LSSP48449 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LSSP48449 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LSSP48449 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LSSP48449 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LSSP48449 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LSSP48449 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LSSP48449 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LSSP48449 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LSSP48449 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LSSP48449 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LSSP48449 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LSSP48449 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LSSP48449 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LSSP48449 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LSSP48449 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LSSP48449 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LSSP48449 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
LSSP48449 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
LSSP48449 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
LSSP48449 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LSSP48449 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LSSP48449 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LSSP48449 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LSSP48449 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LSSP48449 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LSSP48449 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LSSP48449 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LSSP48449 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LSSP48449 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LSSP48449 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LSSP48449 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LSSP48449 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LSSP48449 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LSSP48449 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LSSP48449 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LSSP48449 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LSSP48449 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LSSP48449 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LSSP48449 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LSSP48449 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LSSP48449 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LSSP48449 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LSSP48449 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LSSP48449 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LSSP48449 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LSSP48449 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LSSP48449 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LSSP48449 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LSSP48449 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LSSP48449 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LSSP48449 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LSSP48449 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
LSSP48449 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LSSP48449 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LSSP48449 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LSSP48449 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms