Protein–RNA interactions for Protein: P48165

GJA8, Gap junction alpha-8 protein, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA8P48165 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GJA8P48165 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GJA8P48165 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
GJA8P48165 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GJA8P48165 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GJA8P48165 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GJA8P48165 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GJA8P48165 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GJA8P48165 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GJA8P48165 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
GJA8P48165 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
GJA8P48165 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GJA8P48165 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GJA8P48165 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GJA8P48165 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GJA8P48165 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
GJA8P48165 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GJA8P48165 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GJA8P48165 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GJA8P48165 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GJA8P48165 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GJA8P48165 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
GJA8P48165 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GJA8P48165 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GJA8P48165 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GJA8P48165 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GJA8P48165 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GJA8P48165 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GJA8P48165 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GJA8P48165 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GJA8P48165 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GJA8P48165 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GJA8P48165 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GJA8P48165 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GJA8P48165 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GJA8P48165 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
GJA8P48165 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
GJA8P48165 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GJA8P48165 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
GJA8P48165 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GJA8P48165 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GJA8P48165 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GJA8P48165 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GJA8P48165 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GJA8P48165 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GJA8P48165 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GJA8P48165 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GJA8P48165 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GJA8P48165 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GJA8P48165 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GJA8P48165 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GJA8P48165 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GJA8P48165 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GJA8P48165 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GJA8P48165 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GJA8P48165 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GJA8P48165 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GJA8P48165 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GJA8P48165 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GJA8P48165 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
GJA8P48165 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
GJA8P48165 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
GJA8P48165 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GJA8P48165 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GJA8P48165 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GJA8P48165 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GJA8P48165 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GJA8P48165 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
GJA8P48165 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GJA8P48165 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GJA8P48165 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GJA8P48165 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GJA8P48165 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GJA8P48165 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GJA8P48165 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GJA8P48165 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GJA8P48165 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
GJA8P48165 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GJA8P48165 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GJA8P48165 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GJA8P48165 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GJA8P48165 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
GJA8P48165 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GJA8P48165 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GJA8P48165 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
GJA8P48165 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
GJA8P48165 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
GJA8P48165 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
GJA8P48165 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
GJA8P48165 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
GJA8P48165 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GJA8P48165 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GJA8P48165 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GJA8P48165 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
GJA8P48165 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GJA8P48165 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GJA8P48165 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GJA8P48165 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GJA8P48165 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GJA8P48165 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms