Protein–RNA interactions for Protein: P47972

NPTX2, Neuronal pentraxin-2, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX2P47972 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NPTX2P47972 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NPTX2P47972 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NPTX2P47972 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NPTX2P47972 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NPTX2P47972 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NPTX2P47972 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NPTX2P47972 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NPTX2P47972 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NPTX2P47972 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NPTX2P47972 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NPTX2P47972 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
NPTX2P47972 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NPTX2P47972 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NPTX2P47972 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NPTX2P47972 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NPTX2P47972 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NPTX2P47972 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NPTX2P47972 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NPTX2P47972 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NPTX2P47972 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NPTX2P47972 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NPTX2P47972 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NPTX2P47972 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NPTX2P47972 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
NPTX2P47972 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NPTX2P47972 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NPTX2P47972 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NPTX2P47972 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NPTX2P47972 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
NPTX2P47972 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NPTX2P47972 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NPTX2P47972 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NPTX2P47972 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NPTX2P47972 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NPTX2P47972 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NPTX2P47972 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NPTX2P47972 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NPTX2P47972 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NPTX2P47972 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
NPTX2P47972 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NPTX2P47972 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NPTX2P47972 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NPTX2P47972 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NPTX2P47972 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NPTX2P47972 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NPTX2P47972 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NPTX2P47972 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NPTX2P47972 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
NPTX2P47972 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NPTX2P47972 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NPTX2P47972 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NPTX2P47972 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NPTX2P47972 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NPTX2P47972 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NPTX2P47972 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NPTX2P47972 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NPTX2P47972 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NPTX2P47972 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NPTX2P47972 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NPTX2P47972 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NPTX2P47972 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NPTX2P47972 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NPTX2P47972 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NPTX2P47972 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NPTX2P47972 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NPTX2P47972 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NPTX2P47972 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NPTX2P47972 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NPTX2P47972 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
NPTX2P47972 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NPTX2P47972 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
NPTX2P47972 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
NPTX2P47972 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
NPTX2P47972 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NPTX2P47972 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NPTX2P47972 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NPTX2P47972 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NPTX2P47972 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NPTX2P47972 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NPTX2P47972 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NPTX2P47972 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NPTX2P47972 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NPTX2P47972 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NPTX2P47972 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
NPTX2P47972 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
NPTX2P47972 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
NPTX2P47972 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NPTX2P47972 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NPTX2P47972 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NPTX2P47972 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NPTX2P47972 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NPTX2P47972 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NPTX2P47972 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NPTX2P47972 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NPTX2P47972 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NPTX2P47972 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NPTX2P47972 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NPTX2P47972 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NPTX2P47972 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms