Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NEDD4P46934 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NEDD4P46934 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NEDD4P46934 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NEDD4P46934 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NEDD4P46934 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NEDD4P46934 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NEDD4P46934 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NEDD4P46934 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NEDD4P46934 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NEDD4P46934 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NEDD4P46934 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NEDD4P46934 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NEDD4P46934 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NEDD4P46934 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NEDD4P46934 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NEDD4P46934 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NEDD4P46934 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
NEDD4P46934 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
NEDD4P46934 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NEDD4P46934 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NEDD4P46934 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NEDD4P46934 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NEDD4P46934 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NEDD4P46934 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NEDD4P46934 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NEDD4P46934 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NEDD4P46934 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NEDD4P46934 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NEDD4P46934 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NEDD4P46934 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NEDD4P46934 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NEDD4P46934 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NEDD4P46934 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NEDD4P46934 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NEDD4P46934 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NEDD4P46934 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NEDD4P46934 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NEDD4P46934 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NEDD4P46934 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NEDD4P46934 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NEDD4P46934 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NEDD4P46934 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NEDD4P46934 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NEDD4P46934 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NEDD4P46934 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
NEDD4P46934 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NEDD4P46934 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NEDD4P46934 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
NEDD4P46934 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NEDD4P46934 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NEDD4P46934 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NEDD4P46934 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NEDD4P46934 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NEDD4P46934 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NEDD4P46934 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NEDD4P46934 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NEDD4P46934 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NEDD4P46934 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NEDD4P46934 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NEDD4P46934 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NEDD4P46934 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NEDD4P46934 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
NEDD4P46934 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.58■■■□□ 2.16
NEDD4P46934 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NEDD4P46934 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
NEDD4P46934 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NEDD4P46934 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NEDD4P46934 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NEDD4P46934 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NEDD4P46934 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NEDD4P46934 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NEDD4P46934 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NEDD4P46934 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NEDD4P46934 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
NEDD4P46934 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NEDD4P46934 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NEDD4P46934 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NEDD4P46934 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NEDD4P46934 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NEDD4P46934 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NEDD4P46934 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NEDD4P46934 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NEDD4P46934 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NEDD4P46934 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NEDD4P46934 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NEDD4P46934 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NEDD4P46934 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NEDD4P46934 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NEDD4P46934 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NEDD4P46934 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NEDD4P46934 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NEDD4P46934 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
NEDD4P46934 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NEDD4P46934 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NEDD4P46934 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NEDD4P46934 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NEDD4P46934 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
NEDD4P46934 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NEDD4P46934 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms