Protein–RNA interactions for Protein: P43351

RAD52, DNA repair protein RAD52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD52P43351 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAD52P43351 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAD52P43351 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAD52P43351 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RAD52P43351 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RAD52P43351 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAD52P43351 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAD52P43351 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RAD52P43351 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAD52P43351 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAD52P43351 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAD52P43351 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RAD52P43351 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAD52P43351 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAD52P43351 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAD52P43351 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAD52P43351 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAD52P43351 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RAD52P43351 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RAD52P43351 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RAD52P43351 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RAD52P43351 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAD52P43351 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
RAD52P43351 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RAD52P43351 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RAD52P43351 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAD52P43351 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RAD52P43351 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAD52P43351 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAD52P43351 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RAD52P43351 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RAD52P43351 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
RAD52P43351 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAD52P43351 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RAD52P43351 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAD52P43351 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAD52P43351 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAD52P43351 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAD52P43351 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RAD52P43351 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAD52P43351 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAD52P43351 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAD52P43351 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAD52P43351 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAD52P43351 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAD52P43351 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAD52P43351 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAD52P43351 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAD52P43351 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAD52P43351 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAD52P43351 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAD52P43351 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAD52P43351 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAD52P43351 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAD52P43351 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAD52P43351 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAD52P43351 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAD52P43351 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAD52P43351 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAD52P43351 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAD52P43351 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAD52P43351 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAD52P43351 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAD52P43351 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAD52P43351 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAD52P43351 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RAD52P43351 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAD52P43351 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAD52P43351 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RAD52P43351 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAD52P43351 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAD52P43351 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAD52P43351 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAD52P43351 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RAD52P43351 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAD52P43351 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAD52P43351 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAD52P43351 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAD52P43351 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAD52P43351 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAD52P43351 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAD52P43351 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAD52P43351 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAD52P43351 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAD52P43351 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAD52P43351 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAD52P43351 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAD52P43351 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAD52P43351 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAD52P43351 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAD52P43351 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAD52P43351 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAD52P43351 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
RAD52P43351 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
RAD52P43351 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAD52P43351 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
RAD52P43351 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAD52P43351 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAD52P43351 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAD52P43351 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms