Protein–RNA interactions for Protein: P41271

NBL1, Neuroblastoma suppressor of tumorigenicity 1, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBL1P41271 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NBL1P41271 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NBL1P41271 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NBL1P41271 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NBL1P41271 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NBL1P41271 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NBL1P41271 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NBL1P41271 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NBL1P41271 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NBL1P41271 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NBL1P41271 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NBL1P41271 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NBL1P41271 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NBL1P41271 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NBL1P41271 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NBL1P41271 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NBL1P41271 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NBL1P41271 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NBL1P41271 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NBL1P41271 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NBL1P41271 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NBL1P41271 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NBL1P41271 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NBL1P41271 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NBL1P41271 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NBL1P41271 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NBL1P41271 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NBL1P41271 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NBL1P41271 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NBL1P41271 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NBL1P41271 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NBL1P41271 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NBL1P41271 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NBL1P41271 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NBL1P41271 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NBL1P41271 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NBL1P41271 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NBL1P41271 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NBL1P41271 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NBL1P41271 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NBL1P41271 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NBL1P41271 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NBL1P41271 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NBL1P41271 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NBL1P41271 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NBL1P41271 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NBL1P41271 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NBL1P41271 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NBL1P41271 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NBL1P41271 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NBL1P41271 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NBL1P41271 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NBL1P41271 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NBL1P41271 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NBL1P41271 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NBL1P41271 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NBL1P41271 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NBL1P41271 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NBL1P41271 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NBL1P41271 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NBL1P41271 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NBL1P41271 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NBL1P41271 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NBL1P41271 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NBL1P41271 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NBL1P41271 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NBL1P41271 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NBL1P41271 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NBL1P41271 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NBL1P41271 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NBL1P41271 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NBL1P41271 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NBL1P41271 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NBL1P41271 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NBL1P41271 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NBL1P41271 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NBL1P41271 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NBL1P41271 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NBL1P41271 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NBL1P41271 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NBL1P41271 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NBL1P41271 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NBL1P41271 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NBL1P41271 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NBL1P41271 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NBL1P41271 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NBL1P41271 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NBL1P41271 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NBL1P41271 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NBL1P41271 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NBL1P41271 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NBL1P41271 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NBL1P41271 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NBL1P41271 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NBL1P41271 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NBL1P41271 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NBL1P41271 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NBL1P41271 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NBL1P41271 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NBL1P41271 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms