Protein–RNA interactions for Protein: P41229

KDM5C, Lysine-specific demethylase 5C, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5CP41229 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
KDM5CP41229 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
KDM5CP41229 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.02■■■■□ 3.52
KDM5CP41229 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
KDM5CP41229 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.52
KDM5CP41229 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.51
KDM5CP41229 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.51
KDM5CP41229 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
KDM5CP41229 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
KDM5CP41229 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
KDM5CP41229 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
KDM5CP41229 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
KDM5CP41229 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC36.99■■■■□ 3.51
KDM5CP41229 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
KDM5CP41229 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC36.98■■■■□ 3.51
KDM5CP41229 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
KDM5CP41229 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
KDM5CP41229 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
KDM5CP41229 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
KDM5CP41229 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC36.97■■■■□ 3.51
KDM5CP41229 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC36.97■■■■□ 3.51
KDM5CP41229 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.97■■■■□ 3.51
KDM5CP41229 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC36.97■■■■□ 3.51
KDM5CP41229 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
KDM5CP41229 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC36.97■■■■□ 3.51
KDM5CP41229 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
KDM5CP41229 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
KDM5CP41229 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
KDM5CP41229 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.95■■■■□ 3.51
KDM5CP41229 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
KDM5CP41229 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC36.95■■■■□ 3.51
KDM5CP41229 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
KDM5CP41229 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC36.95■■■■□ 3.51
KDM5CP41229 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
KDM5CP41229 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
KDM5CP41229 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
KDM5CP41229 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
KDM5CP41229 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
KDM5CP41229 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
KDM5CP41229 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC36.94■■■■□ 3.5
KDM5CP41229 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
KDM5CP41229 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC36.93■■■■□ 3.5
KDM5CP41229 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
KDM5CP41229 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
KDM5CP41229 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
KDM5CP41229 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
KDM5CP41229 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
KDM5CP41229 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC36.91■■■■□ 3.5
KDM5CP41229 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
KDM5CP41229 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
KDM5CP41229 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
KDM5CP41229 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
KDM5CP41229 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
KDM5CP41229 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
KDM5CP41229 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC36.9■■■■□ 3.5
KDM5CP41229 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
KDM5CP41229 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
KDM5CP41229 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
KDM5CP41229 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC36.87■■■■□ 3.49
KDM5CP41229 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
KDM5CP41229 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
KDM5CP41229 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
KDM5CP41229 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
KDM5CP41229 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
KDM5CP41229 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC36.86■■■■□ 3.49
KDM5CP41229 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC36.85■■■■□ 3.49
KDM5CP41229 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC36.85■■■■□ 3.49
KDM5CP41229 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
KDM5CP41229 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
KDM5CP41229 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
KDM5CP41229 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC36.84■■■■□ 3.49
KDM5CP41229 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
KDM5CP41229 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
KDM5CP41229 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC36.83■■■■□ 3.49
KDM5CP41229 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
KDM5CP41229 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
KDM5CP41229 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
KDM5CP41229 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.49
KDM5CP41229 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
KDM5CP41229 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
KDM5CP41229 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
KDM5CP41229 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
KDM5CP41229 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
KDM5CP41229 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC36.8■■■■□ 3.48
KDM5CP41229 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
KDM5CP41229 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
KDM5CP41229 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
KDM5CP41229 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC36.78■■■■□ 3.48
KDM5CP41229 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
KDM5CP41229 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
KDM5CP41229 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
KDM5CP41229 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
KDM5CP41229 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC36.77■■■■□ 3.48
KDM5CP41229 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
KDM5CP41229 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC36.77■■■■□ 3.48
KDM5CP41229 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
KDM5CP41229 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
KDM5CP41229 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC36.76■■■■□ 3.48
KDM5CP41229 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
KDM5CP41229 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.4 ms