Protein–RNA interactions for Protein: P35968

KDR, Vascular endothelial growth factor receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDRP35968 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
KDRP35968 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
KDRP35968 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
KDRP35968 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
KDRP35968 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
KDRP35968 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.74
KDRP35968 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
KDRP35968 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
KDRP35968 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
KDRP35968 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
KDRP35968 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
KDRP35968 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
KDRP35968 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
KDRP35968 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
KDRP35968 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
KDRP35968 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
KDRP35968 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
KDRP35968 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
KDRP35968 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
KDRP35968 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
KDRP35968 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
KDRP35968 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
KDRP35968 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
KDRP35968 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
KDRP35968 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
KDRP35968 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
KDRP35968 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
KDRP35968 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
KDRP35968 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
KDRP35968 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
KDRP35968 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
KDRP35968 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
KDRP35968 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
KDRP35968 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
KDRP35968 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
KDRP35968 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
KDRP35968 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
KDRP35968 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
KDRP35968 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
KDRP35968 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
KDRP35968 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
KDRP35968 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
KDRP35968 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
KDRP35968 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
KDRP35968 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
KDRP35968 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
KDRP35968 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
KDRP35968 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
KDRP35968 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
KDRP35968 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
KDRP35968 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
KDRP35968 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
KDRP35968 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
KDRP35968 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
KDRP35968 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
KDRP35968 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
KDRP35968 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
KDRP35968 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
KDRP35968 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
KDRP35968 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
KDRP35968 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
KDRP35968 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
KDRP35968 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
KDRP35968 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
KDRP35968 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
KDRP35968 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC32.06■■■□□ 2.72
KDRP35968 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
KDRP35968 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
KDRP35968 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
KDRP35968 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
KDRP35968 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
KDRP35968 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
KDRP35968 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
KDRP35968 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
KDRP35968 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
KDRP35968 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC32.04■■■□□ 2.72
KDRP35968 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
KDRP35968 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
KDRP35968 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
KDRP35968 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
KDRP35968 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
KDRP35968 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
KDRP35968 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
KDRP35968 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
KDRP35968 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
KDRP35968 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
KDRP35968 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
KDRP35968 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
KDRP35968 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
KDRP35968 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
KDRP35968 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
KDRP35968 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
KDRP35968 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
KDRP35968 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC32■■■□□ 2.71
KDRP35968 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
KDRP35968 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
KDRP35968 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
KDRP35968 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
KDRP35968 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
KDRP35968 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms