Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
COPB2P35606 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
COPB2P35606 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
COPB2P35606 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
COPB2P35606 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
COPB2P35606 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
COPB2P35606 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
COPB2P35606 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
COPB2P35606 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
COPB2P35606 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
COPB2P35606 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
COPB2P35606 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
COPB2P35606 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
COPB2P35606 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
COPB2P35606 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
COPB2P35606 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
COPB2P35606 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
COPB2P35606 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
COPB2P35606 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
COPB2P35606 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
COPB2P35606 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
COPB2P35606 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
COPB2P35606 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
COPB2P35606 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
COPB2P35606 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
COPB2P35606 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
COPB2P35606 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
COPB2P35606 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
COPB2P35606 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
COPB2P35606 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
COPB2P35606 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
COPB2P35606 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
COPB2P35606 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
COPB2P35606 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
COPB2P35606 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
COPB2P35606 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
COPB2P35606 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
COPB2P35606 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
COPB2P35606 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
COPB2P35606 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
COPB2P35606 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
COPB2P35606 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
COPB2P35606 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
COPB2P35606 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
COPB2P35606 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
COPB2P35606 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
COPB2P35606 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
COPB2P35606 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
COPB2P35606 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
COPB2P35606 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
COPB2P35606 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
COPB2P35606 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
COPB2P35606 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
COPB2P35606 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
COPB2P35606 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
COPB2P35606 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
COPB2P35606 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
COPB2P35606 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
COPB2P35606 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
COPB2P35606 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
COPB2P35606 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
COPB2P35606 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
COPB2P35606 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
COPB2P35606 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
COPB2P35606 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
COPB2P35606 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
COPB2P35606 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
COPB2P35606 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
COPB2P35606 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
COPB2P35606 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
COPB2P35606 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
COPB2P35606 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
COPB2P35606 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
COPB2P35606 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
COPB2P35606 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
COPB2P35606 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
COPB2P35606 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
COPB2P35606 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
COPB2P35606 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
COPB2P35606 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
COPB2P35606 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
COPB2P35606 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
COPB2P35606 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
COPB2P35606 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
COPB2P35606 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
COPB2P35606 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
COPB2P35606 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
COPB2P35606 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
COPB2P35606 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
COPB2P35606 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
COPB2P35606 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
COPB2P35606 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
COPB2P35606 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
COPB2P35606 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
COPB2P35606 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
COPB2P35606 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
COPB2P35606 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
COPB2P35606 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
COPB2P35606 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
COPB2P35606 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms