Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXD12P35452 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXD12P35452 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXD12P35452 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXD12P35452 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXD12P35452 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXD12P35452 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXD12P35452 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXD12P35452 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXD12P35452 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXD12P35452 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXD12P35452 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXD12P35452 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXD12P35452 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXD12P35452 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXD12P35452 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXD12P35452 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXD12P35452 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXD12P35452 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXD12P35452 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXD12P35452 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXD12P35452 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXD12P35452 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXD12P35452 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXD12P35452 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXD12P35452 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXD12P35452 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXD12P35452 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXD12P35452 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXD12P35452 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXD12P35452 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXD12P35452 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXD12P35452 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HOXD12P35452 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXD12P35452 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXD12P35452 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXD12P35452 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXD12P35452 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXD12P35452 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXD12P35452 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXD12P35452 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXD12P35452 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXD12P35452 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXD12P35452 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXD12P35452 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXD12P35452 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXD12P35452 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXD12P35452 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXD12P35452 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXD12P35452 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXD12P35452 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXD12P35452 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXD12P35452 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXD12P35452 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXD12P35452 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXD12P35452 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXD12P35452 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXD12P35452 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXD12P35452 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXD12P35452 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXD12P35452 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXD12P35452 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXD12P35452 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXD12P35452 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXD12P35452 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXD12P35452 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXD12P35452 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXD12P35452 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXD12P35452 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXD12P35452 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXD12P35452 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXD12P35452 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXD12P35452 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXD12P35452 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXD12P35452 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXD12P35452 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXD12P35452 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXD12P35452 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXD12P35452 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXD12P35452 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXD12P35452 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXD12P35452 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXD12P35452 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXD12P35452 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXD12P35452 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXD12P35452 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXD12P35452 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXD12P35452 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXD12P35452 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXD12P35452 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXD12P35452 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXD12P35452 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXD12P35452 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXD12P35452 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXD12P35452 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXD12P35452 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXD12P35452 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXD12P35452 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXD12P35452 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXD12P35452 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms