Protein–RNA interactions for Protein: P30876

POLR2B, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2BP30876 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
POLR2BP30876 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
POLR2BP30876 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
POLR2BP30876 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
POLR2BP30876 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
POLR2BP30876 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
POLR2BP30876 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
POLR2BP30876 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
POLR2BP30876 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
POLR2BP30876 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
POLR2BP30876 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
POLR2BP30876 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
POLR2BP30876 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
POLR2BP30876 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
POLR2BP30876 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLR2BP30876 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLR2BP30876 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLR2BP30876 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLR2BP30876 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
POLR2BP30876 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLR2BP30876 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLR2BP30876 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLR2BP30876 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLR2BP30876 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLR2BP30876 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLR2BP30876 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLR2BP30876 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLR2BP30876 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLR2BP30876 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLR2BP30876 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLR2BP30876 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLR2BP30876 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLR2BP30876 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
POLR2BP30876 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
POLR2BP30876 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLR2BP30876 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLR2BP30876 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLR2BP30876 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLR2BP30876 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLR2BP30876 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLR2BP30876 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLR2BP30876 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
POLR2BP30876 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLR2BP30876 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLR2BP30876 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLR2BP30876 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLR2BP30876 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
POLR2BP30876 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR2BP30876 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR2BP30876 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR2BP30876 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR2BP30876 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR2BP30876 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR2BP30876 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR2BP30876 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR2BP30876 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR2BP30876 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR2BP30876 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR2BP30876 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLR2BP30876 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLR2BP30876 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLR2BP30876 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLR2BP30876 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLR2BP30876 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLR2BP30876 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLR2BP30876 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLR2BP30876 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLR2BP30876 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
POLR2BP30876 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
POLR2BP30876 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLR2BP30876 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLR2BP30876 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLR2BP30876 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLR2BP30876 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLR2BP30876 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLR2BP30876 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLR2BP30876 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLR2BP30876 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLR2BP30876 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLR2BP30876 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLR2BP30876 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
POLR2BP30876 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
POLR2BP30876 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
POLR2BP30876 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
POLR2BP30876 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
POLR2BP30876 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
POLR2BP30876 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
POLR2BP30876 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
POLR2BP30876 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
POLR2BP30876 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
POLR2BP30876 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
POLR2BP30876 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
POLR2BP30876 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
POLR2BP30876 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
POLR2BP30876 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
POLR2BP30876 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
POLR2BP30876 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
POLR2BP30876 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
POLR2BP30876 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
POLR2BP30876 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms