Protein–RNA interactions for Protein: P30307

CDC25C, M-phase inducer phosphatase 3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC25CP30307 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDC25CP30307 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDC25CP30307 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDC25CP30307 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDC25CP30307 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDC25CP30307 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDC25CP30307 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDC25CP30307 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDC25CP30307 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDC25CP30307 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDC25CP30307 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDC25CP30307 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDC25CP30307 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDC25CP30307 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDC25CP30307 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDC25CP30307 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDC25CP30307 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDC25CP30307 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDC25CP30307 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDC25CP30307 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDC25CP30307 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDC25CP30307 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDC25CP30307 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDC25CP30307 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDC25CP30307 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDC25CP30307 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDC25CP30307 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDC25CP30307 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDC25CP30307 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDC25CP30307 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDC25CP30307 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDC25CP30307 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDC25CP30307 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CDC25CP30307 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDC25CP30307 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDC25CP30307 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDC25CP30307 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDC25CP30307 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CDC25CP30307 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDC25CP30307 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDC25CP30307 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDC25CP30307 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDC25CP30307 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDC25CP30307 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDC25CP30307 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDC25CP30307 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDC25CP30307 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDC25CP30307 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CDC25CP30307 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDC25CP30307 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDC25CP30307 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDC25CP30307 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDC25CP30307 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDC25CP30307 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDC25CP30307 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDC25CP30307 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDC25CP30307 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDC25CP30307 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDC25CP30307 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CDC25CP30307 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CDC25CP30307 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDC25CP30307 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CDC25CP30307 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDC25CP30307 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDC25CP30307 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDC25CP30307 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDC25CP30307 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDC25CP30307 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDC25CP30307 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDC25CP30307 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDC25CP30307 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CDC25CP30307 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDC25CP30307 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDC25CP30307 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDC25CP30307 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CDC25CP30307 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDC25CP30307 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDC25CP30307 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDC25CP30307 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDC25CP30307 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDC25CP30307 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDC25CP30307 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDC25CP30307 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDC25CP30307 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CDC25CP30307 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDC25CP30307 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CDC25CP30307 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDC25CP30307 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDC25CP30307 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDC25CP30307 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDC25CP30307 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CDC25CP30307 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDC25CP30307 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDC25CP30307 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDC25CP30307 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDC25CP30307 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDC25CP30307 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDC25CP30307 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDC25CP30307 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDC25CP30307 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms