Protein–RNA interactions for Protein: P29966

MARCKS, Myristoylated alanine-rich C-kinase substrate, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCKSP29966 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MARCKSP29966 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MARCKSP29966 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MARCKSP29966 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MARCKSP29966 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MARCKSP29966 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MARCKSP29966 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MARCKSP29966 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MARCKSP29966 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MARCKSP29966 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MARCKSP29966 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MARCKSP29966 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
MARCKSP29966 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MARCKSP29966 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MARCKSP29966 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MARCKSP29966 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MARCKSP29966 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MARCKSP29966 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MARCKSP29966 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MARCKSP29966 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MARCKSP29966 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MARCKSP29966 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MARCKSP29966 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MARCKSP29966 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MARCKSP29966 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MARCKSP29966 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
MARCKSP29966 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MARCKSP29966 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
MARCKSP29966 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
MARCKSP29966 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
MARCKSP29966 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
MARCKSP29966 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MARCKSP29966 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MARCKSP29966 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MARCKSP29966 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
MARCKSP29966 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MARCKSP29966 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MARCKSP29966 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MARCKSP29966 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.55■■■□□ 2
MARCKSP29966 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
MARCKSP29966 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MARCKSP29966 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MARCKSP29966 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MARCKSP29966 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MARCKSP29966 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.54■■■□□ 2
MARCKSP29966 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MARCKSP29966 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MARCKSP29966 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MARCKSP29966 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
MARCKSP29966 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MARCKSP29966 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
MARCKSP29966 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MARCKSP29966 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MARCKSP29966 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
MARCKSP29966 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MARCKSP29966 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MARCKSP29966 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.51■■■□□ 2
MARCKSP29966 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MARCKSP29966 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MARCKSP29966 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MARCKSP29966 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MARCKSP29966 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MARCKSP29966 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MARCKSP29966 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MARCKSP29966 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MARCKSP29966 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MARCKSP29966 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MARCKSP29966 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MARCKSP29966 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MARCKSP29966 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MARCKSP29966 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MARCKSP29966 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MARCKSP29966 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MARCKSP29966 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MARCKSP29966 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MARCKSP29966 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MARCKSP29966 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MARCKSP29966 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MARCKSP29966 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MARCKSP29966 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MARCKSP29966 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MARCKSP29966 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MARCKSP29966 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MARCKSP29966 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MARCKSP29966 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
MARCKSP29966 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
MARCKSP29966 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
MARCKSP29966 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
MARCKSP29966 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
MARCKSP29966 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MARCKSP29966 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MARCKSP29966 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MARCKSP29966 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MARCKSP29966 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MARCKSP29966 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MARCKSP29966 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MARCKSP29966 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MARCKSP29966 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MARCKSP29966 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
MARCKSP29966 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms