Protein–RNA interactions for Protein: P29120

PCSK1, Neuroendocrine convertase 1, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK1P29120 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCSK1P29120 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCSK1P29120 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCSK1P29120 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCSK1P29120 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCSK1P29120 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCSK1P29120 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCSK1P29120 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCSK1P29120 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCSK1P29120 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCSK1P29120 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCSK1P29120 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCSK1P29120 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCSK1P29120 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCSK1P29120 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCSK1P29120 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCSK1P29120 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCSK1P29120 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCSK1P29120 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCSK1P29120 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCSK1P29120 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCSK1P29120 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCSK1P29120 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCSK1P29120 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCSK1P29120 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCSK1P29120 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCSK1P29120 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCSK1P29120 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCSK1P29120 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCSK1P29120 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCSK1P29120 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCSK1P29120 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCSK1P29120 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCSK1P29120 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCSK1P29120 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCSK1P29120 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCSK1P29120 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCSK1P29120 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCSK1P29120 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PCSK1P29120 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCSK1P29120 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PCSK1P29120 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCSK1P29120 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCSK1P29120 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCSK1P29120 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PCSK1P29120 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PCSK1P29120 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PCSK1P29120 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PCSK1P29120 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCSK1P29120 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCSK1P29120 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCSK1P29120 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCSK1P29120 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCSK1P29120 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCSK1P29120 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCSK1P29120 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCSK1P29120 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCSK1P29120 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCSK1P29120 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCSK1P29120 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCSK1P29120 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCSK1P29120 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCSK1P29120 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCSK1P29120 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCSK1P29120 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCSK1P29120 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCSK1P29120 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCSK1P29120 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCSK1P29120 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCSK1P29120 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCSK1P29120 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCSK1P29120 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PCSK1P29120 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PCSK1P29120 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PCSK1P29120 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PCSK1P29120 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PCSK1P29120 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PCSK1P29120 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PCSK1P29120 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PCSK1P29120 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PCSK1P29120 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PCSK1P29120 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PCSK1P29120 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PCSK1P29120 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCSK1P29120 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCSK1P29120 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCSK1P29120 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCSK1P29120 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCSK1P29120 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCSK1P29120 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCSK1P29120 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PCSK1P29120 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCSK1P29120 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCSK1P29120 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PCSK1P29120 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCSK1P29120 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCSK1P29120 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCSK1P29120 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PCSK1P29120 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCSK1P29120 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms