Protein–RNA interactions for Protein: P26374

CHML, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMLP26374 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CHMLP26374 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CHMLP26374 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CHMLP26374 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CHMLP26374 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
CHMLP26374 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CHMLP26374 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
CHMLP26374 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CHMLP26374 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CHMLP26374 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CHMLP26374 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CHMLP26374 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CHMLP26374 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CHMLP26374 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CHMLP26374 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CHMLP26374 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CHMLP26374 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CHMLP26374 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CHMLP26374 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CHMLP26374 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CHMLP26374 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CHMLP26374 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CHMLP26374 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CHMLP26374 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CHMLP26374 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
CHMLP26374 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CHMLP26374 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CHMLP26374 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CHMLP26374 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CHMLP26374 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
CHMLP26374 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CHMLP26374 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CHMLP26374 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CHMLP26374 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CHMLP26374 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CHMLP26374 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CHMLP26374 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CHMLP26374 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CHMLP26374 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CHMLP26374 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
CHMLP26374 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CHMLP26374 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CHMLP26374 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CHMLP26374 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CHMLP26374 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CHMLP26374 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CHMLP26374 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CHMLP26374 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CHMLP26374 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CHMLP26374 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CHMLP26374 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CHMLP26374 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CHMLP26374 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CHMLP26374 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CHMLP26374 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CHMLP26374 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
CHMLP26374 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CHMLP26374 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CHMLP26374 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CHMLP26374 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CHMLP26374 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CHMLP26374 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CHMLP26374 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CHMLP26374 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CHMLP26374 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CHMLP26374 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CHMLP26374 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
CHMLP26374 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CHMLP26374 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CHMLP26374 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CHMLP26374 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CHMLP26374 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CHMLP26374 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CHMLP26374 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CHMLP26374 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CHMLP26374 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CHMLP26374 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CHMLP26374 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CHMLP26374 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CHMLP26374 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CHMLP26374 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CHMLP26374 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CHMLP26374 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CHMLP26374 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CHMLP26374 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CHMLP26374 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CHMLP26374 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CHMLP26374 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CHMLP26374 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CHMLP26374 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CHMLP26374 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CHMLP26374 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CHMLP26374 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CHMLP26374 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CHMLP26374 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CHMLP26374 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CHMLP26374 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CHMLP26374 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CHMLP26374 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CHMLP26374 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms