Protein–RNA interactions for Protein: P24864

CCNE1, G1/S-specific cyclin-E1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE1P24864 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCNE1P24864 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCNE1P24864 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCNE1P24864 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCNE1P24864 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCNE1P24864 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CCNE1P24864 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCNE1P24864 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCNE1P24864 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCNE1P24864 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCNE1P24864 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCNE1P24864 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCNE1P24864 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCNE1P24864 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCNE1P24864 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCNE1P24864 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCNE1P24864 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCNE1P24864 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCNE1P24864 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCNE1P24864 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCNE1P24864 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCNE1P24864 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCNE1P24864 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCNE1P24864 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCNE1P24864 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCNE1P24864 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCNE1P24864 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCNE1P24864 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCNE1P24864 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCNE1P24864 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCNE1P24864 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCNE1P24864 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCNE1P24864 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CCNE1P24864 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CCNE1P24864 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCNE1P24864 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCNE1P24864 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCNE1P24864 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
CCNE1P24864 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCNE1P24864 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCNE1P24864 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCNE1P24864 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCNE1P24864 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCNE1P24864 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCNE1P24864 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCNE1P24864 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCNE1P24864 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCNE1P24864 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCNE1P24864 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCNE1P24864 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCNE1P24864 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCNE1P24864 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CCNE1P24864 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCNE1P24864 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCNE1P24864 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCNE1P24864 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCNE1P24864 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCNE1P24864 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCNE1P24864 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CCNE1P24864 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCNE1P24864 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCNE1P24864 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCNE1P24864 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCNE1P24864 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCNE1P24864 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCNE1P24864 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCNE1P24864 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCNE1P24864 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCNE1P24864 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCNE1P24864 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CCNE1P24864 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCNE1P24864 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCNE1P24864 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCNE1P24864 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCNE1P24864 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCNE1P24864 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCNE1P24864 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCNE1P24864 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCNE1P24864 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCNE1P24864 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCNE1P24864 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
CCNE1P24864 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCNE1P24864 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCNE1P24864 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCNE1P24864 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCNE1P24864 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCNE1P24864 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCNE1P24864 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCNE1P24864 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCNE1P24864 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCNE1P24864 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCNE1P24864 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCNE1P24864 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCNE1P24864 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCNE1P24864 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCNE1P24864 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCNE1P24864 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCNE1P24864 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCNE1P24864 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCNE1P24864 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.8 ms