Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPREP23469 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPREP23469 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PTPREP23469 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PTPREP23469 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PTPREP23469 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PTPREP23469 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PTPREP23469 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PTPREP23469 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPREP23469 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPREP23469 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPREP23469 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPREP23469 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPREP23469 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPREP23469 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPREP23469 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPREP23469 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPREP23469 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPREP23469 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPREP23469 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPREP23469 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPREP23469 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPREP23469 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPREP23469 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPREP23469 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPREP23469 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPREP23469 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPREP23469 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPREP23469 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPREP23469 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPREP23469 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPREP23469 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPREP23469 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPREP23469 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPREP23469 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTPREP23469 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTPREP23469 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTPREP23469 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTPREP23469 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTPREP23469 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPREP23469 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPREP23469 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPREP23469 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPREP23469 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPREP23469 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPREP23469 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPREP23469 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPREP23469 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPREP23469 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPREP23469 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPREP23469 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPREP23469 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPREP23469 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPREP23469 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPREP23469 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPREP23469 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPREP23469 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPREP23469 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPREP23469 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPREP23469 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPREP23469 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPREP23469 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPREP23469 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPREP23469 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPREP23469 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPREP23469 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPREP23469 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPREP23469 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPREP23469 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPREP23469 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPREP23469 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPREP23469 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPREP23469 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPREP23469 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
PTPREP23469 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
PTPREP23469 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPREP23469 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPREP23469 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPREP23469 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPREP23469 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPREP23469 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPREP23469 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPREP23469 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPREP23469 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPREP23469 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTPREP23469 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTPREP23469 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTPREP23469 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTPREP23469 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTPREP23469 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPREP23469 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPREP23469 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPREP23469 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPREP23469 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPREP23469 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPREP23469 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPREP23469 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPREP23469 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPREP23469 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPREP23469 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms