Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP4AP20648 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP4AP20648 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP4AP20648 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATP4AP20648 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATP4AP20648 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATP4AP20648 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATP4AP20648 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATP4AP20648 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATP4AP20648 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATP4AP20648 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATP4AP20648 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP4AP20648 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP4AP20648 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP4AP20648 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP4AP20648 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP4AP20648 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP4AP20648 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP4AP20648 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP4AP20648 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP4AP20648 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP4AP20648 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP4AP20648 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP4AP20648 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP4AP20648 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP4AP20648 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP4AP20648 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP4AP20648 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP4AP20648 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP4AP20648 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATP4AP20648 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATP4AP20648 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATP4AP20648 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATP4AP20648 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATP4AP20648 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ATP4AP20648 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ATP4AP20648 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ATP4AP20648 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ATP4AP20648 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ATP4AP20648 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATP4AP20648 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATP4AP20648 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATP4AP20648 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATP4AP20648 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
ATP4AP20648 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATP4AP20648 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP4AP20648 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP4AP20648 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP4AP20648 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP4AP20648 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP4AP20648 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP4AP20648 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP4AP20648 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP4AP20648 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP4AP20648 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP4AP20648 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATP4AP20648 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATP4AP20648 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
ATP4AP20648 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATP4AP20648 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATP4AP20648 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATP4AP20648 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATP4AP20648 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
ATP4AP20648 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATP4AP20648 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ATP4AP20648 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATP4AP20648 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATP4AP20648 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATP4AP20648 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATP4AP20648 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATP4AP20648 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATP4AP20648 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATP4AP20648 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
ATP4AP20648 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATP4AP20648 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATP4AP20648 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATP4AP20648 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATP4AP20648 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATP4AP20648 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATP4AP20648 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATP4AP20648 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATP4AP20648 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATP4AP20648 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATP4AP20648 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATP4AP20648 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
ATP4AP20648 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATP4AP20648 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATP4AP20648 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATP4AP20648 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATP4AP20648 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATP4AP20648 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ATP4AP20648 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ATP4AP20648 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ATP4AP20648 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATP4AP20648 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATP4AP20648 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATP4AP20648 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATP4AP20648 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATP4AP20648 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATP4AP20648 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms