Protein–RNA interactions for Protein: P20062

TCN2, Transcobalamin-2, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCN2P20062 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCN2P20062 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCN2P20062 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCN2P20062 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCN2P20062 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TCN2P20062 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCN2P20062 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TCN2P20062 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TCN2P20062 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCN2P20062 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCN2P20062 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCN2P20062 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCN2P20062 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCN2P20062 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCN2P20062 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCN2P20062 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCN2P20062 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCN2P20062 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCN2P20062 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCN2P20062 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCN2P20062 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCN2P20062 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TCN2P20062 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TCN2P20062 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TCN2P20062 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TCN2P20062 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TCN2P20062 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TCN2P20062 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TCN2P20062 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TCN2P20062 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCN2P20062 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCN2P20062 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCN2P20062 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCN2P20062 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCN2P20062 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCN2P20062 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCN2P20062 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCN2P20062 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCN2P20062 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCN2P20062 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCN2P20062 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCN2P20062 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCN2P20062 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCN2P20062 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCN2P20062 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCN2P20062 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCN2P20062 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCN2P20062 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TCN2P20062 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCN2P20062 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCN2P20062 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCN2P20062 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCN2P20062 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCN2P20062 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCN2P20062 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCN2P20062 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCN2P20062 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCN2P20062 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCN2P20062 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCN2P20062 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCN2P20062 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCN2P20062 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCN2P20062 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCN2P20062 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCN2P20062 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCN2P20062 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCN2P20062 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCN2P20062 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCN2P20062 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCN2P20062 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCN2P20062 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TCN2P20062 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCN2P20062 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCN2P20062 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCN2P20062 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCN2P20062 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCN2P20062 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCN2P20062 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCN2P20062 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCN2P20062 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCN2P20062 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TCN2P20062 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TCN2P20062 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCN2P20062 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCN2P20062 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCN2P20062 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCN2P20062 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCN2P20062 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCN2P20062 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TCN2P20062 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TCN2P20062 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCN2P20062 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCN2P20062 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCN2P20062 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCN2P20062 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCN2P20062 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCN2P20062 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCN2P20062 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCN2P20062 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCN2P20062 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms