Protein–RNA interactions for Protein: P19388

POLR2E, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2EP19388 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLR2EP19388 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR2EP19388 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR2EP19388 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR2EP19388 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR2EP19388 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
POLR2EP19388 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
POLR2EP19388 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLR2EP19388 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLR2EP19388 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLR2EP19388 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLR2EP19388 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLR2EP19388 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR2EP19388 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR2EP19388 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR2EP19388 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR2EP19388 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR2EP19388 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR2EP19388 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR2EP19388 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR2EP19388 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR2EP19388 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR2EP19388 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLR2EP19388 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLR2EP19388 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLR2EP19388 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLR2EP19388 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLR2EP19388 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLR2EP19388 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLR2EP19388 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLR2EP19388 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLR2EP19388 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
POLR2EP19388 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLR2EP19388 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLR2EP19388 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLR2EP19388 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR2EP19388 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR2EP19388 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR2EP19388 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR2EP19388 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR2EP19388 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR2EP19388 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR2EP19388 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR2EP19388 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR2EP19388 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR2EP19388 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR2EP19388 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLR2EP19388 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
POLR2EP19388 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLR2EP19388 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLR2EP19388 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
POLR2EP19388 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
POLR2EP19388 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
POLR2EP19388 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
POLR2EP19388 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
POLR2EP19388 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
POLR2EP19388 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
POLR2EP19388 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
POLR2EP19388 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR2EP19388 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR2EP19388 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR2EP19388 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR2EP19388 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR2EP19388 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR2EP19388 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR2EP19388 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR2EP19388 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR2EP19388 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR2EP19388 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR2EP19388 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR2EP19388 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR2EP19388 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR2EP19388 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLR2EP19388 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLR2EP19388 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLR2EP19388 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLR2EP19388 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLR2EP19388 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLR2EP19388 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLR2EP19388 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLR2EP19388 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLR2EP19388 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLR2EP19388 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLR2EP19388 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLR2EP19388 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLR2EP19388 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLR2EP19388 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLR2EP19388 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLR2EP19388 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLR2EP19388 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLR2EP19388 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLR2EP19388 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLR2EP19388 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLR2EP19388 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
POLR2EP19388 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLR2EP19388 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLR2EP19388 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLR2EP19388 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLR2EP19388 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLR2EP19388 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms