Protein–RNA interactions for Protein: P17900

GM2A, Ganglioside GM2 activator, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GM2AP17900 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GM2AP17900 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GM2AP17900 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GM2AP17900 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GM2AP17900 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GM2AP17900 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GM2AP17900 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GM2AP17900 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GM2AP17900 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GM2AP17900 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GM2AP17900 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GM2AP17900 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GM2AP17900 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GM2AP17900 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GM2AP17900 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GM2AP17900 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GM2AP17900 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GM2AP17900 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GM2AP17900 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
GM2AP17900 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GM2AP17900 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GM2AP17900 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GM2AP17900 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GM2AP17900 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GM2AP17900 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GM2AP17900 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GM2AP17900 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GM2AP17900 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GM2AP17900 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GM2AP17900 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GM2AP17900 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GM2AP17900 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GM2AP17900 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GM2AP17900 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GM2AP17900 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GM2AP17900 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GM2AP17900 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GM2AP17900 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GM2AP17900 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GM2AP17900 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GM2AP17900 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GM2AP17900 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GM2AP17900 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GM2AP17900 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GM2AP17900 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GM2AP17900 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GM2AP17900 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GM2AP17900 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GM2AP17900 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GM2AP17900 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
GM2AP17900 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GM2AP17900 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GM2AP17900 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GM2AP17900 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GM2AP17900 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GM2AP17900 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GM2AP17900 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GM2AP17900 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
GM2AP17900 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GM2AP17900 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GM2AP17900 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GM2AP17900 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GM2AP17900 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GM2AP17900 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GM2AP17900 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GM2AP17900 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GM2AP17900 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
GM2AP17900 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GM2AP17900 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GM2AP17900 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GM2AP17900 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GM2AP17900 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GM2AP17900 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
GM2AP17900 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GM2AP17900 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GM2AP17900 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GM2AP17900 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GM2AP17900 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GM2AP17900 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GM2AP17900 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GM2AP17900 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GM2AP17900 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
GM2AP17900 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GM2AP17900 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GM2AP17900 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GM2AP17900 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
GM2AP17900 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
GM2AP17900 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GM2AP17900 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GM2AP17900 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GM2AP17900 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GM2AP17900 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GM2AP17900 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GM2AP17900 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GM2AP17900 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GM2AP17900 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GM2AP17900 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GM2AP17900 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GM2AP17900 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GM2AP17900 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms