Protein–RNA interactions for Protein: P17707

AMD1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMD1P17707 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
AMD1P17707 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
AMD1P17707 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AMD1P17707 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AMD1P17707 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
AMD1P17707 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
AMD1P17707 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
AMD1P17707 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
AMD1P17707 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
AMD1P17707 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AMD1P17707 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
AMD1P17707 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
AMD1P17707 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
AMD1P17707 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AMD1P17707 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
AMD1P17707 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AMD1P17707 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
AMD1P17707 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
AMD1P17707 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AMD1P17707 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
AMD1P17707 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
AMD1P17707 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AMD1P17707 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AMD1P17707 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AMD1P17707 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AMD1P17707 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
AMD1P17707 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AMD1P17707 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AMD1P17707 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
AMD1P17707 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
AMD1P17707 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
AMD1P17707 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AMD1P17707 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AMD1P17707 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AMD1P17707 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AMD1P17707 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AMD1P17707 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
AMD1P17707 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
AMD1P17707 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AMD1P17707 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
AMD1P17707 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
AMD1P17707 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AMD1P17707 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AMD1P17707 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AMD1P17707 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AMD1P17707 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
AMD1P17707 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
AMD1P17707 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
AMD1P17707 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
AMD1P17707 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
AMD1P17707 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AMD1P17707 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AMD1P17707 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
AMD1P17707 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
AMD1P17707 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
AMD1P17707 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AMD1P17707 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AMD1P17707 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AMD1P17707 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AMD1P17707 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
AMD1P17707 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
AMD1P17707 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AMD1P17707 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
AMD1P17707 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
AMD1P17707 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
AMD1P17707 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
AMD1P17707 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
AMD1P17707 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
AMD1P17707 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AMD1P17707 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AMD1P17707 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AMD1P17707 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
AMD1P17707 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AMD1P17707 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AMD1P17707 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AMD1P17707 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AMD1P17707 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AMD1P17707 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AMD1P17707 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AMD1P17707 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AMD1P17707 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AMD1P17707 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
AMD1P17707 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AMD1P17707 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
AMD1P17707 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AMD1P17707 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AMD1P17707 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
AMD1P17707 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AMD1P17707 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AMD1P17707 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AMD1P17707 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AMD1P17707 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AMD1P17707 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
AMD1P17707 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AMD1P17707 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AMD1P17707 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
AMD1P17707 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AMD1P17707 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
AMD1P17707 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AMD1P17707 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms